228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0092 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  100 
 
 		 319 aa  652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  67.83 
 
 		 434 aa  325  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  53.71 
 
 		 490 aa  255  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  35.2 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  33.33 
 
 		 540 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  32.95 
 
 		 541 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  32.56 
 
 		 532 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  32.56 
 
 		 540 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  35.78 
 
 		 528 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  32.56 
 
 		 540 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  33.77 
 
 		 541 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  33.77 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  35.11 
 
 		 529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  32.18 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  32.61 
 
 		 529 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  37.64 
 
 		 552 aa  109  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  37.64 
 
 		 552 aa  109  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  30.29 
 
 		 563 aa  109  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.49 
 
 		 551 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  37.5 
 
 		 549 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  34.33 
 
 		 506 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  33.09 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.06 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  37.14 
 
 		 1103 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  37.5 
 
 		 550 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  37.65 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  35.14 
 
 		 550 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  33.17 
 
 		 549 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  29.46 
 
 		 571 aa  99  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  30.04 
 
 		 567 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  34.71 
 
 		 552 aa  97.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  32.87 
 
 		 548 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.58 
 
 		 552 aa  96.3  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  32.02 
 
 		 546 aa  95.9  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  34.42 
 
 		 330 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  29.88 
 
 		 552 aa  95.9  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  40.12 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  35 
 
 		 560 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  30.3 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  26.57 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  33.33 
 
 		 603 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  30.35 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.71 
 
 		 569 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  32.94 
 
 		 545 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  37 
 
 		 491 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  30.74 
 
 		 537 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  33.18 
 
 		 547 aa  93.6  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.29 
 
 		 556 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  34.74 
 
 		 555 aa  92.8  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  32.2 
 
 		 575 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.4 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.38 
 
 		 550 aa  91.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  28.38 
 
 		 398 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  33.95 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  32.84 
 
 		 549 aa  89.7  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  28.38 
 
 		 384 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  28.05 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  29.09 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  33.79 
 
 		 506 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  30.64 
 
 		 553 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  28.05 
 
 		 393 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  29.43 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  32.85 
 
 		 539 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  30.62 
 
 		 542 aa  86.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  34.44 
 
 		 552 aa  85.9  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  32.12 
 
 		 563 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  34.24 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  32.96 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  34.25 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  30.25 
 
 		 557 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  31.14 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  35.45 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.79 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  28.84 
 
 		 563 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  30.88 
 
 		 503 aa  83.2  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  28.52 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  33.71 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  31.69 
 
 		 557 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  34.18 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  32.9 
 
 		 534 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  31.69 
 
 		 557 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  29.68 
 
 		 558 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.57 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.57 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.99 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  32.28 
 
 		 557 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  27.46 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  32.97 
 
 		 531 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  32.7 
 
 		 548 aa  79.7  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.15 
 
 		 558 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  28.57 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31.52 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  31.18 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  31.55 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  28.43 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  30 
 
 		 528 aa  75.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  28.57 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  36.07 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  32.5 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.81 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>