228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2197 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  95.26 
 
 		 506 aa  1001    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  71.24 
 
 		 549 aa  774    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  60 
 
 		 537 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  88.33 
 
 		 540 aa  999    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  87.97 
 
 		 532 aa  982    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  100 
 
 		 541 aa  1115    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  99.63 
 
 		 541 aa  1110    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  69.11 
 
 		 529 aa  766    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  97.78 
 
 		 541 aa  1092    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  71.84 
 
 		 529 aa  782    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  87.96 
 
 		 540 aa  997    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  87.59 
 
 		 540 aa  991    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  73.01 
 
 		 528 aa  792    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  86.82 
 
 		 532 aa  973    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  57.63 
 
 		 550 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  47.28 
 
 		 552 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  47.82 
 
 		 547 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  47.83 
 
 		 551 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  45.79 
 
 		 555 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  45.28 
 
 		 546 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  43.92 
 
 		 558 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  43.92 
 
 		 558 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  43.73 
 
 		 558 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  44.59 
 
 		 563 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  43.73 
 
 		 558 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  43.73 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  43.33 
 
 		 557 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  42.99 
 
 		 552 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  43.73 
 
 		 557 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  43.14 
 
 		 557 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  43.53 
 
 		 557 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  41.92 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  43.05 
 
 		 552 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  41.64 
 
 		 548 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  44.11 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  42.16 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  41.03 
 
 		 567 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  41.7 
 
 		 597 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  42.86 
 
 		 603 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  42.01 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  41.7 
 
 		 549 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  42.69 
 
 		 542 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  41.14 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  43.13 
 
 		 575 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  41.36 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  40.69 
 
 		 550 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  40.3 
 
 		 552 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  40.11 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  39.54 
 
 		 548 aa  363  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  41.04 
 
 		 563 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  37.02 
 
 		 559 aa  329  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  35.33 
 
 		 573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  34.94 
 
 		 573 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  34.43 
 
 		 563 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.43 
 
 		 552 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  28.98 
 
 		 552 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  29.21 
 
 		 529 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.69 
 
 		 560 aa  186  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  32.77 
 
 		 551 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.19 
 
 		 539 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  29.71 
 
 		 506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.47 
 
 		 545 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  30.78 
 
 		 598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  27.45 
 
 		 558 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.75 
 
 		 533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.43 
 
 		 546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.11 
 
 		 531 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  26.53 
 
 		 539 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  29.31 
 
 		 506 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.67 
 
 		 528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  24.95 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  35 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  24.91 
 
 		 579 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  30.78 
 
 		 623 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  32.99 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.13 
 
 		 491 aa  119  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.23 
 
 		 944 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  26.03 
 
 		 394 aa  113  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  33.77 
 
 		 319 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  30.61 
 
 		 434 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  26.13 
 
 		 503 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  23.7 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  33.47 
 
 		 341 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  32.62 
 
 		 334 aa  94.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  33.64 
 
 		 301 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.7 
 
 		 407 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.99 
 
 		 674 aa  89.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  23.38 
 
 		 420 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  34.95 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  34.97 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.14 
 
 		 318 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  33.01 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  27.08 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  34.54 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  31.34 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.32 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  38.71 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.82 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  38.33 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  38.94 
 
 		 1103 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>