224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0042 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  63.39 
 
 		 545 aa  720    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  100 
 
 		 552 aa  1137    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  48.54 
 
 		 552 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  42.16 
 
 		 551 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  45.14 
 
 		 539 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  45.02 
 
 		 558 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  41.92 
 
 		 560 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  35.16 
 
 		 529 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  34.9 
 
 		 548 aa  280  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  34.29 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  35 
 
 		 534 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.98 
 
 		 546 aa  246  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  33.65 
 
 		 549 aa  243  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.27 
 
 		 555 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  31.14 
 
 		 550 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31 
 
 		 575 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  31.19 
 
 		 551 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  34.43 
 
 		 563 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  31.12 
 
 		 547 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  31.47 
 
 		 552 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  33.27 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  32.93 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  32.81 
 
 		 552 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  31.83 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  30.37 
 
 		 567 aa  223  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  30.94 
 
 		 549 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  30.45 
 
 		 597 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  29.82 
 
 		 491 aa  211  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  31.12 
 
 		 556 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  30.12 
 
 		 540 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  30.62 
 
 		 558 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  30.62 
 
 		 558 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  30.51 
 
 		 542 aa  203  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.91 
 
 		 532 aa  203  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  30.19 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  32.59 
 
 		 552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  29.3 
 
 		 550 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  29.92 
 
 		 540 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  30.22 
 
 		 558 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  29.73 
 
 		 540 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.29 
 
 		 569 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  29.73 
 
 		 532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  30.36 
 
 		 553 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  31.31 
 
 		 571 aa  196  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.75 
 
 		 603 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  28.79 
 
 		 548 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  29.37 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.73 
 
 		 557 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  29.56 
 
 		 558 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.73 
 
 		 557 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  29.28 
 
 		 529 aa  194  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.96 
 
 		 541 aa  193  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  29.2 
 
 		 557 aa  193  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.56 
 
 		 557 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.18 
 
 		 522 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  30.74 
 
 		 528 aa  190  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  29.89 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.98 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.98 
 
 		 541 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  30.87 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  28.49 
 
 		 506 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  27.89 
 
 		 559 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  29.73 
 
 		 529 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  30.19 
 
 		 563 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  29.15 
 
 		 549 aa  180  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  28.78 
 
 		 528 aa  179  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  30.05 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  30.66 
 
 		 579 aa  170  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.57 
 
 		 503 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  27 
 
 		 506 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  27.29 
 
 		 674 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.05 
 
 		 598 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  30.94 
 
 		 623 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  27.07 
 
 		 573 aa  143  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  27.2 
 
 		 573 aa  140  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.73 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  25.81 
 
 		 944 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  41.1 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  33.33 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  38.82 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  33.2 
 
 		 334 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.86 
 
 		 323 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  30.92 
 
 		 514 aa  98.2  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  34.71 
 
 		 319 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  34.81 
 
 		 490 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  33.33 
 
 		 315 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  24.53 
 
 		 555 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  26.18 
 
 		 465 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.38 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.19 
 
 		 309 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  30.73 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.81 
 
 		 574 aa  81.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  24.47 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  24.47 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  30.34 
 
 		 301 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  31.28 
 
 		 330 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  27.8 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  24.28 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  30.3 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  31.84 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>