230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4032 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  82.12 
 
 		 346 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  80.91 
 
 		 346 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  79.59 
 
 		 346 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  70 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  69.69 
 
 		 384 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  68.75 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  68.75 
 
 		 386 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  51.97 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  50.31 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  48.18 
 
 		 353 aa  318  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  48.62 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  47.48 
 
 		 323 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  46.49 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  46.3 
 
 		 341 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  34.28 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  36.98 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  36.03 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31.03 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  31.79 
 
 		 325 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  31.43 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  30 
 
 		 407 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  28.35 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  28.52 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.63 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  28.53 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  33.02 
 
 		 623 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  33.64 
 
 		 555 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  29.03 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.05 
 
 		 674 aa  93.2  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  28.52 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  24.62 
 
 		 341 aa  92.8  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.97 
 
 		 1103 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.9 
 
 		 574 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  28.44 
 
 		 394 aa  86.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.75 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29.76 
 
 		 579 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  33.17 
 
 		 598 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  32.02 
 
 		 944 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  29 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.69 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.37 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30.81 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.31 
 
 		 528 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  26.71 
 
 		 546 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  32.26 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.44 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  31.9 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  26.67 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  24.39 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.37 
 
 		 503 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  29.88 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  28.24 
 
 		 571 aa  70.1  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  27.68 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  29.84 
 
 		 529 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.89 
 
 		 540 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.17 
 
 		 391 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  29.12 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  31.89 
 
 		 552 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  29.12 
 
 		 447 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  28.42 
 
 		 569 aa  67  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  28.89 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.89 
 
 		 540 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.85 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  28.89 
 
 		 540 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  30.05 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  29.61 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  27.78 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  28.78 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  28.17 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  29.24 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.12 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  29.29 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  33.33 
 
 		 584 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  27.36 
 
 		 764 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.6 
 
 		 532 aa  63.2  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.72 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  28.21 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  27 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  31.06 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  27.6 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  29.88 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  30.05 
 
 		 553 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.38 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  33.82 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  28.18 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.12 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.12 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.12 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  27.37 
 
 		 557 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  31.69 
 
 		 542 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  34.75 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  27.95 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  31.18 
 
 		 541 aa  59.7  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3061  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.06 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.29 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3126  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.06 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  31.18 
 
 		 541 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3246  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.06 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3087  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  30.06 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>