287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0032 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  100 
 
 		 394 aa  802    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  40.85 
 
 		 420 aa  315  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  39.2 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  26.74 
 
 		 546 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  26.22 
 
 		 598 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  26.03 
 
 		 541 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  27.75 
 
 		 555 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  26.03 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  36.02 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  25.8 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  24.09 
 
 		 532 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  24.37 
 
 		 506 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  25.51 
 
 		 529 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  37.38 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  33.65 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  26.39 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  29 
 
 		 539 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  34.83 
 
 		 309 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  39.47 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.1 
 
 		 491 aa  102  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  35.64 
 
 		 552 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  35.64 
 
 		 552 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  38.74 
 
 		 552 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  31.34 
 
 		 540 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  34.31 
 
 		 407 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  33.06 
 
 		 549 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  33.33 
 
 		 563 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  30.95 
 
 		 567 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  30.85 
 
 		 532 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  32.54 
 
 		 308 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  30.85 
 
 		 540 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  30.85 
 
 		 540 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  46.15 
 
 		 422 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  36.93 
 
 		 545 aa  96.7  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  31.96 
 
 		 549 aa  96.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  35.53 
 
 		 571 aa  96.7  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  24.94 
 
 		 506 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  36.1 
 
 		 603 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  30.39 
 
 		 528 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  32.39 
 
 		 551 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  30.12 
 
 		 548 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  35.98 
 
 		 323 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  32.99 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  30.32 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  35.47 
 
 		 550 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  31.22 
 
 		 579 aa  93.2  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  30.89 
 
 		 546 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.14 
 
 		 674 aa  92.8  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  30.54 
 
 		 529 aa  92.8  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.31 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  31.63 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  30.26 
 
 		 533 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  33.51 
 
 		 548 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  32.06 
 
 		 555 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  33.85 
 
 		 346 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  29.71 
 
 		 547 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  31.72 
 
 		 537 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  35.26 
 
 		 557 aa  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  34.55 
 
 		 558 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  34.55 
 
 		 558 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.39 
 
 		 553 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  34.5 
 
 		 623 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  33.17 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  33.83 
 
 		 552 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  30.04 
 
 		 560 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  22.57 
 
 		 531 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  30.2 
 
 		 575 aa  87.8  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  25.8 
 
 		 490 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  35.63 
 
 		 558 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  32.04 
 
 		 322 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  28.36 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  33.53 
 
 		 569 aa  86.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  31.75 
 
 		 559 aa  86.3  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  27.72 
 
 		 346 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.91 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  24.33 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  29.19 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  32.2 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  33.91 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  30.35 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  32.66 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  23.57 
 
 		 944 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  33.51 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  23.69 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.96 
 
 		 551 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  30.05 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  34.1 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  30.54 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  44.25 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  31.03 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  35.39 
 
 		 557 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  29.17 
 
 		 549 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  35.39 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  32.07 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  29.06 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  32.92 
 
 		 574 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  33.33 
 
 		 557 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  26.87 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  33.17 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.81 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>