222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1880 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  89.5 
 
 
506 aa  951    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  58.43 
 
 
537 aa  653    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  100 
 
 
540 aa  1112    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  71.16 
 
 
549 aa  783    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  57.88 
 
 
550 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  88.33 
 
 
541 aa  999    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  88.15 
 
 
541 aa  996    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  69.94 
 
 
529 aa  766    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  99.06 
 
 
532 aa  1087    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  87.59 
 
 
541 aa  998    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  98.89 
 
 
540 aa  1103    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  72.08 
 
 
529 aa  768    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  97.96 
 
 
540 aa  1090    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  72.82 
 
 
528 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  86.82 
 
 
532 aa  963    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  47.94 
 
 
552 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  48.05 
 
 
547 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  49.21 
 
 
551 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  45.88 
 
 
555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  45.7 
 
 
546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  43.95 
 
 
563 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  43.59 
 
 
558 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  43.59 
 
 
558 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  44.08 
 
 
558 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  43.59 
 
 
558 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  44.02 
 
 
552 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  43.6 
 
 
552 aa  422  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  43.88 
 
 
557 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  43.69 
 
 
522 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  43.5 
 
 
557 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  40.77 
 
 
567 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  43.3 
 
 
557 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  42.03 
 
 
569 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  43.3 
 
 
557 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  41.32 
 
 
597 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  42.1 
 
 
553 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  42.38 
 
 
550 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  41.29 
 
 
556 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  42.97 
 
 
571 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  41.88 
 
 
549 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  43.11 
 
 
542 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  42.75 
 
 
603 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  40.77 
 
 
548 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  43.77 
 
 
575 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  40.76 
 
 
549 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  40.33 
 
 
550 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  40.52 
 
 
552 aa  365  1e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  40.33 
 
 
552 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  39.16 
 
 
548 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  41.23 
 
 
563 aa  353  5e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  37.98 
 
 
559 aa  339  9e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  35.27 
 
 
573 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  35.34 
 
 
573 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  33.4 
 
 
563 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.84 
 
 
552 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  29.92 
 
 
552 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  29.52 
 
 
529 aa  199  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  30.2 
 
 
506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.02 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.77 
 
 
551 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.07 
 
 
539 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  30.18 
 
 
545 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.71 
 
 
598 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.24 
 
 
558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.8 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.52 
 
 
533 aa  147  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.26 
 
 
531 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  26.86 
 
 
539 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  28.57 
 
 
506 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  25.68 
 
 
528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  30.15 
 
 
514 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.2 
 
 
491 aa  120  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  34.78 
 
 
490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  30.33 
 
 
623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  25.19 
 
 
579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.14 
 
 
944 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.56 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  33 
 
 
534 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  30.8 
 
 
434 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  26.07 
 
 
503 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.85 
 
 
394 aa  97.8  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.73 
 
 
334 aa  97.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.33 
 
 
341 aa  94.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  23.26 
 
 
424 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.75 
 
 
674 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  32.06 
 
 
301 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.56 
 
 
407 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  37.93 
 
 
309 aa  90.5  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  34.02 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.58 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  34.31 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  23.23 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  27.57 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  34.57 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  33.77 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  24.32 
 
 
555 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.44 
 
 
574 aa  73.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  33.49 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30.77 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  31.46 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>