213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1045 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  100 
 
 
560 aa  1140    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  45.34 
 
 
552 aa  432  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  41.92 
 
 
552 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  42.6 
 
 
545 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  42.07 
 
 
558 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  40.04 
 
 
539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  36.93 
 
 
551 aa  326  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  31.87 
 
 
529 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  31.01 
 
 
548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  31.25 
 
 
539 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  28.8 
 
 
563 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  32.76 
 
 
534 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  30.51 
 
 
550 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  29.08 
 
 
546 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  32.12 
 
 
567 aa  200  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  30.68 
 
 
506 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  31.19 
 
 
563 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  28.26 
 
 
547 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.34 
 
 
532 aa  194  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  28.21 
 
 
540 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  27.44 
 
 
552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  28.22 
 
 
532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.02 
 
 
540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.44 
 
 
540 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  31.61 
 
 
551 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.58 
 
 
603 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.07 
 
 
571 aa  189  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.69 
 
 
541 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.69 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  28.11 
 
 
537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.69 
 
 
541 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  28.93 
 
 
506 aa  183  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  27.7 
 
 
555 aa  183  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  27.73 
 
 
550 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.28 
 
 
491 aa  182  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  29.29 
 
 
549 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  27.7 
 
 
549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.07 
 
 
531 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  29.1 
 
 
575 aa  173  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.16 
 
 
529 aa  173  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  28.02 
 
 
528 aa  170  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  28.34 
 
 
549 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  28.14 
 
 
529 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.83 
 
 
546 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  28.73 
 
 
522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  28.73 
 
 
559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.38 
 
 
557 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  29.06 
 
 
552 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  29.7 
 
 
553 aa  163  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  27.93 
 
 
550 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.16 
 
 
558 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.16 
 
 
558 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  27.14 
 
 
548 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  27.52 
 
 
552 aa  160  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  27.09 
 
 
557 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  27.95 
 
 
558 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  27.77 
 
 
556 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  28.57 
 
 
552 aa  158  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  28.37 
 
 
557 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.4 
 
 
579 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  26.71 
 
 
597 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  28.37 
 
 
557 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.6 
 
 
558 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.27 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.51 
 
 
552 aa  153  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  29.22 
 
 
542 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  29.18 
 
 
563 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  27.91 
 
 
569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  25.72 
 
 
533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.93 
 
 
598 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  27.83 
 
 
506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  31.08 
 
 
623 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  25.97 
 
 
503 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  25.13 
 
 
674 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  24.42 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  25.47 
 
 
514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  24.21 
 
 
573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  25.3 
 
 
490 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  29.62 
 
 
334 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  31.58 
 
 
325 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  37.78 
 
 
434 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  35 
 
 
319 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.04 
 
 
394 aa  88.2  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  32.09 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  30.81 
 
 
341 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.27 
 
 
574 aa  83.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.23 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  33.86 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30.37 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  33.03 
 
 
1103 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  29.54 
 
 
330 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  36.09 
 
 
323 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.03 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  29.13 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.78 
 
 
555 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.8 
 
 
346 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  35.88 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  28.51 
 
 
308 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  27.95 
 
 
319 aa  72.8  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  32.8 
 
 
447 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>