252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5214 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  100 
 
 		 531 aa  1093    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  52.22 
 
 		 546 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  44.57 
 
 		 533 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  41.68 
 
 		 528 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  40.3 
 
 		 579 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  60.61 
 
 		 334 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  54.96 
 
 		 341 aa  268  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.62 
 
 		 552 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  31.98 
 
 		 539 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.84 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  30.85 
 
 		 545 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  29.8 
 
 		 552 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.34 
 
 		 555 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.91 
 
 		 674 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  29.25 
 
 		 560 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  28.52 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  28.75 
 
 		 548 aa  177  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  30.27 
 
 		 552 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  28.75 
 
 		 539 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  28.36 
 
 		 546 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  28.75 
 
 		 551 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  29.33 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  30.94 
 
 		 563 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  30.92 
 
 		 549 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  31.08 
 
 		 552 aa  167  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  31.08 
 
 		 552 aa  167  5e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  29.31 
 
 		 567 aa  167  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  29.78 
 
 		 551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  31.21 
 
 		 550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  29.86 
 
 		 575 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  29.27 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  30.15 
 
 		 558 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  29.17 
 
 		 553 aa  160  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  28.8 
 
 		 549 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.14 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  29.72 
 
 		 558 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  29.72 
 
 		 558 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  30.98 
 
 		 556 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  29.72 
 
 		 558 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  30 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  28.54 
 
 		 597 aa  157  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  29.31 
 
 		 541 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.85 
 
 		 541 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.57 
 
 		 541 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.69 
 
 		 540 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  28.79 
 
 		 529 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  30.59 
 
 		 557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  27.8 
 
 		 569 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  28.63 
 
 		 552 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.55 
 
 		 557 aa  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  28.66 
 
 		 532 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  28.76 
 
 		 549 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  30.37 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  28.66 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.53 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.66 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.68 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  27.86 
 
 		 529 aa  150  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.32 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  29.72 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  29.15 
 
 		 603 aa  148  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  30.59 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  27.92 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  28.4 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  28.66 
 
 		 542 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  27.92 
 
 		 550 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  26.96 
 
 		 563 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  28.78 
 
 		 506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  28.16 
 
 		 571 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  26.68 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.86 
 
 		 558 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  29.07 
 
 		 534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.74 
 
 		 623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  25.71 
 
 		 559 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  25.92 
 
 		 944 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  28.06 
 
 		 563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  33.86 
 
 		 323 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  35.68 
 
 		 315 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  27.44 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  33.96 
 
 		 407 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  34.4 
 
 		 330 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  33.91 
 
 		 308 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  26.97 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  23.54 
 
 		 573 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.84 
 
 		 309 aa  104  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  40.11 
 
 		 325 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.28 
 
 		 301 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.74 
 
 		 574 aa  103  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30.8 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  23.33 
 
 		 573 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.32 
 
 		 555 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  30.22 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  33.17 
 
 		 318 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  33.81 
 
 		 434 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.78 
 
 		 391 aa  95.9  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  22.57 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  31.05 
 
 		 490 aa  91.3  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  23.87 
 
 		 514 aa  87  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.81 
 
 		 1103 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  29.52 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>