224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03544 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  81.36 
 
 		 571 aa  885    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  100 
 
 		 603 aa  1235    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  58.9 
 
 		 573 aa  689    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  59.25 
 
 		 573 aa  697    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  50.95 
 
 		 563 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  48.66 
 
 		 567 aa  508  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  47.61 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  49.12 
 
 		 551 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  46.26 
 
 		 552 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  50 
 
 		 547 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  46.84 
 
 		 546 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  43.76 
 
 		 558 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  44.61 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  46.88 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  46.65 
 
 		 558 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  46.65 
 
 		 558 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  44.24 
 
 		 557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  44.42 
 
 		 557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  47.41 
 
 		 542 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  44.88 
 
 		 558 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  45.63 
 
 		 522 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  46.2 
 
 		 550 aa  452  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  43.59 
 
 		 557 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  45.45 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  42.48 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  44.42 
 
 		 553 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  41.25 
 
 		 597 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  46.12 
 
 		 552 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  46.12 
 
 		 552 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  44.53 
 
 		 569 aa  429  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  43.06 
 
 		 575 aa  431  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  46.02 
 
 		 549 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  44.53 
 
 		 528 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  45.16 
 
 		 550 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  43.63 
 
 		 556 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  46.31 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  43.52 
 
 		 548 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  43.05 
 
 		 541 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  45.16 
 
 		 548 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  43.05 
 
 		 541 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  42.86 
 
 		 541 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  42.59 
 
 		 550 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  39.15 
 
 		 537 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  43.31 
 
 		 506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  42.99 
 
 		 549 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  42.83 
 
 		 532 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  44.15 
 
 		 529 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  42.48 
 
 		 532 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  42.75 
 
 		 540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  42.72 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  42.53 
 
 		 540 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  43.81 
 
 		 563 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  43.46 
 
 		 559 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  38.11 
 
 		 563 aa  360  6e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.23 
 
 		 552 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.62 
 
 		 552 aa  213  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  31.33 
 
 		 560 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  31.55 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.9 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.75 
 
 		 539 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.62 
 
 		 529 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  32.12 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  30.41 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.37 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.96 
 
 		 491 aa  162  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.92 
 
 		 528 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  32.81 
 
 		 598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.24 
 
 		 533 aa  150  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.15 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.44 
 
 		 579 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.17 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  29.11 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  30 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  36.42 
 
 		 534 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  29.75 
 
 		 503 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  27.35 
 
 		 674 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  35.53 
 
 		 334 aa  117  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.15 
 
 		 944 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  34.9 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  30.72 
 
 		 623 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  32.59 
 
 		 407 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  35.06 
 
 		 341 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  25.34 
 
 		 555 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  36.69 
 
 		 346 aa  98.6  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  33.69 
 
 		 434 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  36.1 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  36.32 
 
 		 309 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  33.33 
 
 		 319 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  37.91 
 
 		 424 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  26.36 
 
 		 420 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  35.11 
 
 		 330 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  32.98 
 
 		 315 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  34.25 
 
 		 342 aa  88.6  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  34.78 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  26.09 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  28.32 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  25.62 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  30.91 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  33.33 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  33.33 
 
 		 447 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>