280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3463 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  100 
 
 		 309 aa  621  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  45.55 
 
 		 319 aa  269  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  45.42 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  44.73 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  35.6 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  35.6 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  37.69 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  35.71 
 
 		 323 aa  172  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  37.92 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  32.06 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  35.29 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  35.69 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  34.46 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  35.62 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  36.03 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  36.04 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  34.27 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  33.21 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  35.69 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  30.48 
 
 		 341 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  33.97 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  32.2 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  33 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  30.22 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.32 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  30.31 
 
 		 574 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.72 
 
 		 346 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  32.44 
 
 		 546 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  34.02 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  34.83 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  33.48 
 
 		 555 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.06 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  37.69 
 
 		 944 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  34.9 
 
 		 503 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  31.98 
 
 		 533 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  32.71 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  31.52 
 
 		 1103 aa  96.3  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  33.84 
 
 		 550 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.35 
 
 		 531 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  31.55 
 
 		 420 aa  95.5  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  38.76 
 
 		 603 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  38.61 
 
 		 529 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  33.53 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  32.84 
 
 		 579 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  39.2 
 
 		 623 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  31.58 
 
 		 528 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  38 
 
 		 540 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  30.9 
 
 		 563 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  35.1 
 
 		 571 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  35.22 
 
 		 540 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  34.31 
 
 		 546 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  35.22 
 
 		 532 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  37.93 
 
 		 540 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  37.23 
 
 		 549 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  30.24 
 
 		 422 aa  89  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.31 
 
 		 674 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.31 
 
 		 598 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  35.84 
 
 		 567 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  32.07 
 
 		 545 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  33.47 
 
 		 539 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.58 
 
 		 391 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  34.95 
 
 		 541 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  34.95 
 
 		 541 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  29.63 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  35.18 
 
 		 506 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  34.95 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  35.62 
 
 		 552 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  32.19 
 
 		 552 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  32.4 
 
 		 549 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  37.3 
 
 		 549 aa  82.8  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  35.78 
 
 		 528 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  32.33 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  28.26 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  32.5 
 
 		 547 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  32.3 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  32.5 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  40.54 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  33.17 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  40.54 
 
 		 552 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.27 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  32.66 
 
 		 537 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  32 
 
 		 555 aa  79.3  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  32.41 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  31.28 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  31.13 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  28.97 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.17 
 
 		 550 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  42.48 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  37.93 
 
 		 553 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  30.13 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  31.25 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.35 
 
 		 569 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  33.52 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.12 
 
 		 539 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  35.88 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  37.59 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  31.52 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  26.87 
 
 		 591 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  30.53 
 
 		 575 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>