211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3653 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  100 
 
 		 506 aa  1040    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  56.67 
 
 		 539 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  41.26 
 
 		 491 aa  382  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  32.67 
 
 		 539 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  31.12 
 
 		 545 aa  216  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.41 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.54 
 
 		 552 aa  210  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  32.25 
 
 		 563 aa  207  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  34.61 
 
 		 558 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  30.87 
 
 		 560 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.98 
 
 		 551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  30.21 
 
 		 548 aa  187  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  29.49 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  29.9 
 
 		 550 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  31.66 
 
 		 552 aa  179  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  30.96 
 
 		 563 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.05 
 
 		 546 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  28.65 
 
 		 549 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  29.37 
 
 		 575 aa  177  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  28.44 
 
 		 567 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  30.57 
 
 		 529 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.15 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  28.79 
 
 		 549 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.22 
 
 		 503 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  30.25 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  27.58 
 
 		 569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  29.07 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  28.83 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.7 
 
 		 528 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  28.86 
 
 		 550 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.52 
 
 		 532 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  26.11 
 
 		 555 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  30.23 
 
 		 528 aa  161  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.98 
 
 		 571 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  27.71 
 
 		 556 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  26.57 
 
 		 558 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  27.06 
 
 		 557 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  26.57 
 
 		 558 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  26.89 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  28.96 
 
 		 552 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  26.65 
 
 		 557 aa  157  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  26.39 
 
 		 558 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.02 
 
 		 551 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.77 
 
 		 541 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  26.48 
 
 		 557 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  26.48 
 
 		 557 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  26.65 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.86 
 
 		 540 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.57 
 
 		 541 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.39 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  27.05 
 
 		 597 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  28.31 
 
 		 537 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  29.08 
 
 		 541 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  27.77 
 
 		 548 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.15 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  28.43 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  27.36 
 
 		 542 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.46 
 
 		 540 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  29.09 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  28.97 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  28.26 
 
 		 540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  29.55 
 
 		 603 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  28.6 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  30.28 
 
 		 534 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  27.29 
 
 		 559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  28.89 
 
 		 529 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.54 
 
 		 552 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.86 
 
 		 579 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  27.44 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  27.68 
 
 		 533 aa  129  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  24.8 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  27.87 
 
 		 563 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  33.2 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  34.17 
 
 		 334 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  26.65 
 
 		 598 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  33.74 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  24.46 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.6 
 
 		 674 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  23.53 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  30.51 
 
 		 555 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  34.1 
 
 		 325 aa  104  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  27.79 
 
 		 623 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  24.94 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.18 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  33.64 
 
 		 319 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  34.48 
 
 		 308 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  33.48 
 
 		 407 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  33.17 
 
 		 301 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  24.88 
 
 		 420 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  26.58 
 
 		 944 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.57 
 
 		 574 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  36.71 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.28 
 
 		 309 aa  90.9  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  34.39 
 
 		 330 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  29.82 
 
 		 318 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  23.58 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.03 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  33.61 
 
 		 1103 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.73 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.71 
 
 		 456 aa  76.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>