233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0301 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  57.35 
 
 		 573 aa  655    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  78.89 
 
 		 603 aa  883    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  57.6 
 
 		 573 aa  657    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  100 
 
 		 571 aa  1164    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  50.18 
 
 		 563 aa  512  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  48.22 
 
 		 567 aa  508  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  49.15 
 
 		 547 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  45.94 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  46.24 
 
 		 552 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  46.77 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  47.04 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  44.74 
 
 		 558 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  44.92 
 
 		 558 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  44.74 
 
 		 558 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  44.74 
 
 		 558 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  44.39 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  43.88 
 
 		 557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  43.71 
 
 		 557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  47.31 
 
 		 550 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  43.32 
 
 		 552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  43.36 
 
 		 557 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  43.32 
 
 		 552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  45.06 
 
 		 522 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  42.58 
 
 		 556 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  43.96 
 
 		 542 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  42.42 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  41.51 
 
 		 597 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  44.3 
 
 		 541 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  43.76 
 
 		 548 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  42.88 
 
 		 553 aa  428  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  40.65 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  44.11 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  44.32 
 
 		 575 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  44.11 
 
 		 541 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  43.7 
 
 		 529 aa  425  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  44.8 
 
 		 549 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  42.97 
 
 		 540 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  42.78 
 
 		 540 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  42.97 
 
 		 532 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  43.68 
 
 		 550 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  42.23 
 
 		 550 aa  415  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  45.01 
 
 		 529 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  43.26 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  43.61 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  42.4 
 
 		 540 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  42.56 
 
 		 532 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  43.96 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  44.53 
 
 		 548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  43.97 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  43.43 
 
 		 549 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  43.96 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  44.89 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  43.13 
 
 		 559 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  38.2 
 
 		 563 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  33.46 
 
 		 552 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  32.28 
 
 		 506 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  33.95 
 
 		 558 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.51 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  33.2 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.84 
 
 		 551 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  30.22 
 
 		 560 aa  203  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.92 
 
 		 545 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  29.96 
 
 		 529 aa  187  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.2 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.02 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  32.2 
 
 		 598 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.63 
 
 		 579 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  26.91 
 
 		 546 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.35 
 
 		 491 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  31.51 
 
 		 506 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.66 
 
 		 539 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  27.59 
 
 		 514 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.52 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  34.65 
 
 		 534 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  29.07 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  38.22 
 
 		 334 aa  117  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.66 
 
 		 944 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  38.2 
 
 		 674 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  34.57 
 
 		 341 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  25.53 
 
 		 555 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  29.46 
 
 		 319 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  32.41 
 
 		 407 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  35.53 
 
 		 394 aa  97.4  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  36.93 
 
 		 346 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  28.94 
 
 		 623 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  35.2 
 
 		 490 aa  93.6  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  35.07 
 
 		 309 aa  91.3  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  31.88 
 
 		 330 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  34.78 
 
 		 424 aa  90.5  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  32.07 
 
 		 434 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  32.43 
 
 		 315 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  33.33 
 
 		 342 aa  87  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  32.22 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  34.55 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  30.59 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  26.45 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  33.33 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  28.92 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  31.25 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  30.14 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>