264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1952 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  59.93 
 
 
550 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  100 
 
 
552 aa  1126    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  72.83 
 
 
549 aa  828    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  72.83 
 
 
549 aa  817    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  99.46 
 
 
552 aa  1119    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  61.42 
 
 
548 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  53.99 
 
 
575 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  52 
 
 
550 aa  525  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  48.22 
 
 
563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  46.14 
 
 
559 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  45.25 
 
 
563 aa  435  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  47.2 
 
 
548 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  42.52 
 
 
567 aa  411  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  43.5 
 
 
553 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  43.58 
 
 
552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  47.16 
 
 
551 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  44.19 
 
 
555 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  46.12 
 
 
603 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  42.53 
 
 
552 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  43.95 
 
 
547 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  43.43 
 
 
558 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  43.24 
 
 
557 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  43.24 
 
 
557 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  43.96 
 
 
571 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  43.24 
 
 
557 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  43.41 
 
 
558 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  43.01 
 
 
558 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  43.41 
 
 
558 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  42.78 
 
 
522 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  41.05 
 
 
556 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  41.46 
 
 
552 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  41.6 
 
 
542 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  43.38 
 
 
546 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  42.29 
 
 
557 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  41.04 
 
 
569 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  40.3 
 
 
541 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  40.3 
 
 
541 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  39.48 
 
 
529 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  40.96 
 
 
541 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  38.76 
 
 
597 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  40.36 
 
 
532 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  39.62 
 
 
550 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  40.88 
 
 
532 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  40.52 
 
 
540 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  41.15 
 
 
540 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  40.38 
 
 
549 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  40.66 
 
 
506 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  40.33 
 
 
540 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  39.96 
 
 
529 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  39.81 
 
 
528 aa  361  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  38.45 
 
 
537 aa  347  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  38.35 
 
 
563 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  37.43 
 
 
573 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  37.05 
 
 
573 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  34.47 
 
 
529 aa  236  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  34.3 
 
 
551 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  32.93 
 
 
552 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.45 
 
 
552 aa  209  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  32.95 
 
 
506 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  33.33 
 
 
539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  31.24 
 
 
545 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  32.12 
 
 
546 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  31.27 
 
 
539 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  31.07 
 
 
558 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  27.52 
 
 
560 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.85 
 
 
533 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.71 
 
 
491 aa  159  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  30.87 
 
 
531 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  29.07 
 
 
506 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  39.64 
 
 
534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.14 
 
 
598 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29.64 
 
 
579 aa  143  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  29.28 
 
 
514 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  31.13 
 
 
503 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  40 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.07 
 
 
528 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  37.39 
 
 
341 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  41.57 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  38.17 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  37.64 
 
 
319 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  39.44 
 
 
674 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  35.64 
 
 
394 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.12 
 
 
944 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.34 
 
 
555 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.79 
 
 
623 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  24.88 
 
 
420 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  35.14 
 
 
407 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  34.36 
 
 
424 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  34.39 
 
 
447 aa  88.2  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  34.78 
 
 
315 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  34.87 
 
 
330 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  34.39 
 
 
447 aa  87.8  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  30.6 
 
 
301 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  34.15 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30.81 
 
 
346 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  30.41 
 
 
318 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  40.54 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  40.57 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.37 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  38.71 
 
 
422 aa  77.4  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>