223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4338 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  100 
 
 		 529 aa  1072    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  43.28 
 
 		 534 aa  344  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  35.56 
 
 		 545 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  35.16 
 
 		 552 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  35.7 
 
 		 551 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  36.2 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  35.67 
 
 		 558 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  35.28 
 
 		 539 aa  273  8.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  31.67 
 
 		 548 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  33.52 
 
 		 549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  33.33 
 
 		 548 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  32.04 
 
 		 549 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  31.87 
 
 		 560 aa  237  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  34.47 
 
 		 552 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  34.47 
 
 		 552 aa  236  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  33.79 
 
 		 550 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  33.79 
 
 		 552 aa  227  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.77 
 
 		 551 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  31.55 
 
 		 563 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31.57 
 
 		 575 aa  217  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  30.95 
 
 		 550 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  32.36 
 
 		 546 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  30 
 
 		 567 aa  210  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  28.92 
 
 		 550 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  30 
 
 		 552 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  31.93 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  31.73 
 
 		 558 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  31.93 
 
 		 558 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  32.03 
 
 		 569 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  29.08 
 
 		 597 aa  203  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  28.91 
 
 		 555 aa  202  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  28.52 
 
 		 537 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  29.87 
 
 		 542 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  29.52 
 
 		 532 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  32.63 
 
 		 563 aa  200  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  29.52 
 
 		 540 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  31.34 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  31.39 
 
 		 558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  30.89 
 
 		 529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  31.39 
 
 		 558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  30.39 
 
 		 556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  28.85 
 
 		 547 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  29.15 
 
 		 540 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  30.96 
 
 		 557 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.84 
 
 		 540 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  29.1 
 
 		 529 aa  194  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  30.96 
 
 		 557 aa  193  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  29.86 
 
 		 557 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.36 
 
 		 532 aa  192  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  30.75 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  29.17 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  29.21 
 
 		 541 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  29.21 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  29.94 
 
 		 506 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  28.99 
 
 		 559 aa  187  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  29.66 
 
 		 552 aa  187  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  29.85 
 
 		 603 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  30.49 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  29.31 
 
 		 571 aa  183  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.31 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  28.63 
 
 		 549 aa  180  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  30.37 
 
 		 563 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  30.58 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  28.15 
 
 		 506 aa  163  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.71 
 
 		 598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.49 
 
 		 546 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.12 
 
 		 579 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.8 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  29.24 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  30.39 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.79 
 
 		 528 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.67 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  26.89 
 
 		 674 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  27.21 
 
 		 514 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  25.3 
 
 		 573 aa  118  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  25.06 
 
 		 573 aa  115  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.63 
 
 		 944 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  27.25 
 
 		 555 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  33.33 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  36.56 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.39 
 
 		 623 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  30.33 
 
 		 341 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  34.87 
 
 		 334 aa  96.3  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  31.28 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  30.36 
 
 		 574 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  32.88 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  30.32 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  34.18 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.4 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  33.52 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  31.09 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  32.67 
 
 		 420 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  29.53 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  30 
 
 		 301 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  27.15 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  35.71 
 
 		 318 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  28.57 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  25.11 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  28.47 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.5 
 
 		 346 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>