277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1817 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  100 
 
 		 559 aa  1117    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  58.7 
 
 		 563 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  47.85 
 
 		 575 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  49.45 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  47.85 
 
 		 550 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  45.34 
 
 		 549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  46.04 
 
 		 552 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  45.86 
 
 		 552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  46.33 
 
 		 548 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  44.68 
 
 		 549 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  42.72 
 
 		 563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  39.71 
 
 		 547 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  39.71 
 
 		 552 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  40 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  39.61 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  40.32 
 
 		 557 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  40.07 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  39.71 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  39.15 
 
 		 558 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  39.15 
 
 		 558 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  39.5 
 
 		 558 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  39.25 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  43.15 
 
 		 571 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  39.17 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  38.66 
 
 		 597 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  39.28 
 
 		 552 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  39.96 
 
 		 567 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  38.95 
 
 		 553 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  38.84 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  39.96 
 
 		 569 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  38.72 
 
 		 552 aa  364  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  42.46 
 
 		 603 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  42.08 
 
 		 548 aa  359  8e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  39.29 
 
 		 542 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  40.08 
 
 		 546 aa  352  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  42.05 
 
 		 551 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  37.18 
 
 		 540 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  36.81 
 
 		 540 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  36.81 
 
 		 532 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  36.86 
 
 		 550 aa  339  9e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  34.48 
 
 		 537 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  36.86 
 
 		 540 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  36.82 
 
 		 541 aa  334  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  37.2 
 
 		 541 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  36.72 
 
 		 541 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  36.45 
 
 		 532 aa  332  9e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  36.64 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  35.97 
 
 		 506 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  34.78 
 
 		 529 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  35.05 
 
 		 529 aa  316  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  35.51 
 
 		 528 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  34.69 
 
 		 573 aa  277  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  34.57 
 
 		 573 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  31.8 
 
 		 563 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.71 
 
 		 552 aa  200  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.37 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.7 
 
 		 529 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.72 
 
 		 552 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  31.65 
 
 		 506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.61 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  34.41 
 
 		 534 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  27.75 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.73 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  29.37 
 
 		 558 aa  153  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.92 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.33 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.77 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  26.78 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  30.57 
 
 		 503 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  27.83 
 
 		 506 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.02 
 
 		 539 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  28.06 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  25.36 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.5 
 
 		 491 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.4 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  31.44 
 
 		 334 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.73 
 
 		 944 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  34.03 
 
 		 341 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  32.43 
 
 		 434 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  32.77 
 
 		 490 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  31.75 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.9 
 
 		 623 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.71 
 
 		 674 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  31.14 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  27.85 
 
 		 487 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  29.33 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  28.3 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  29.38 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  27.17 
 
 		 301 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  29.32 
 
 		 512 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  31.32 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  24.53 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  36.17 
 
 		 725 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  36.07 
 
 		 678 aa  73.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  32.16 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  33.53 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  30.91 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  31.82 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  28.79 
 
 		 947 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  33.33 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>