272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2578 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  100 
 
 		 563 aa  1122    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  58.82 
 
 		 559 aa  619  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  48.41 
 
 		 550 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  45.06 
 
 		 575 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  45.6 
 
 		 550 aa  472  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  48.88 
 
 		 552 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  48.88 
 
 		 552 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  46.24 
 
 		 549 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  45.86 
 
 		 549 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  46.59 
 
 		 563 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  47.47 
 
 		 548 aa  438  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  43.5 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  43.56 
 
 		 547 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  40.61 
 
 		 557 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  41.71 
 
 		 552 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  40.43 
 
 		 557 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  40.61 
 
 		 557 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  45.66 
 
 		 571 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  42.45 
 
 		 558 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  43.15 
 
 		 567 aa  395  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  42.45 
 
 		 558 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  40.39 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  40.61 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  42.34 
 
 		 553 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  44.57 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  41.05 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  41.89 
 
 		 558 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  41.18 
 
 		 522 aa  389  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  41.12 
 
 		 569 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  45.44 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  41.48 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  40.21 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  41.13 
 
 		 552 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  41.97 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  40.07 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  40.11 
 
 		 552 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  40.9 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  40.72 
 
 		 541 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  41.18 
 
 		 542 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  40.72 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  40.72 
 
 		 532 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  40.72 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  40 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  40.54 
 
 		 540 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  40.68 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  40.15 
 
 		 550 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  39.85 
 
 		 528 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  40.42 
 
 		 506 aa  361  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  39.96 
 
 		 529 aa  359  8e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  39.78 
 
 		 529 aa  359  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  40.57 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  34.51 
 
 		 573 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  34.14 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  35.68 
 
 		 563 aa  290  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.03 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.22 
 
 		 552 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  31.4 
 
 		 551 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  32.42 
 
 		 506 aa  193  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.59 
 
 		 539 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  32.04 
 
 		 558 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.3 
 
 		 529 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.12 
 
 		 545 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  30.84 
 
 		 534 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.92 
 
 		 560 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.8 
 
 		 533 aa  143  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.23 
 
 		 528 aa  140  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.69 
 
 		 598 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  28.04 
 
 		 514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  26.92 
 
 		 546 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.67 
 
 		 531 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  35.26 
 
 		 334 aa  117  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.47 
 
 		 579 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  26.23 
 
 		 506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  26.71 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.54 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  26.61 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  25.38 
 
 		 674 aa  107  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  30.62 
 
 		 623 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.05 
 
 		 341 aa  97.1  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  27.67 
 
 		 490 aa  90.5  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  32.93 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.12 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  28.77 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30.09 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  26.76 
 
 		 944 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  28.4 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  38.06 
 
 		 523 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.12 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  34.35 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  32.02 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  33.57 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  32.2 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.41 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  30.04 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  29.43 
 
 		 512 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  30.19 
 
 		 947 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  31.11 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  38.6 
 
 		 1103 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  41.18 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  32.69 
 
 		 678 aa  67.8  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>