299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08756 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  100 
 
 
334 aa  684    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  56.89 
 
 
341 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  63.76 
 
 
546 aa  318  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  63.52 
 
 
533 aa  312  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  60.61 
 
 
531 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  57.2 
 
 
579 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  51.08 
 
 
528 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  37.76 
 
 
503 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  33.22 
 
 
407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  34.9 
 
 
555 aa  135  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  29.33 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  37.66 
 
 
598 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  40 
 
 
552 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  40 
 
 
552 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  30.5 
 
 
398 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  42.33 
 
 
547 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  37.81 
 
 
546 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  30.19 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  37.07 
 
 
674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.73 
 
 
574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  38.74 
 
 
563 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  39.22 
 
 
549 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  31.67 
 
 
330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  36.68 
 
 
550 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  29.34 
 
 
384 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  40 
 
 
556 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  31.47 
 
 
308 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  29.91 
 
 
393 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  37.23 
 
 
558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  37.23 
 
 
558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  34.9 
 
 
549 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  37.23 
 
 
558 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  35.02 
 
 
551 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  38.62 
 
 
552 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  27.39 
 
 
319 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  38.3 
 
 
557 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  33.74 
 
 
539 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  35.64 
 
 
558 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  37.37 
 
 
552 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  36.04 
 
 
553 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  35.11 
 
 
557 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  34.92 
 
 
522 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  35.64 
 
 
557 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  31.1 
 
 
346 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  35.11 
 
 
557 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  38.3 
 
 
552 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  39.27 
 
 
603 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  35.26 
 
 
563 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  38.22 
 
 
571 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  32.39 
 
 
567 aa  116  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  37.26 
 
 
548 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  34.67 
 
 
569 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  30.27 
 
 
318 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  28.57 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  33.03 
 
 
555 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  34.4 
 
 
548 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  30.3 
 
 
346 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  27.76 
 
 
342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  34.57 
 
 
542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  30.55 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  29.39 
 
 
346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  27.73 
 
 
353 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.97 
 
 
346 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  32.3 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  28.01 
 
 
352 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  30.07 
 
 
341 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  31.44 
 
 
559 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  32.4 
 
 
545 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.33 
 
 
552 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  29.77 
 
 
325 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  37.23 
 
 
550 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  31.31 
 
 
623 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  34.05 
 
 
597 aa  102  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  33.51 
 
 
537 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  29.62 
 
 
560 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  32.46 
 
 
549 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  33.2 
 
 
552 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  34.53 
 
 
491 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  28.57 
 
 
323 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31.8 
 
 
575 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  32.49 
 
 
434 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  28.35 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  31.43 
 
 
528 aa  99.8  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  32.86 
 
 
529 aa  99.4  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.22 
 
 
944 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  34.17 
 
 
506 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  28.78 
 
 
1103 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  30.73 
 
 
532 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  30.73 
 
 
540 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  30.73 
 
 
540 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  30.58 
 
 
540 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  34.87 
 
 
529 aa  96.3  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.23 
 
 
551 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  32.09 
 
 
541 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  31.75 
 
 
529 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  28.96 
 
 
550 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  26.57 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  32.62 
 
 
541 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  32.62 
 
 
541 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>