219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1839 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  70.84 
 
 		 558 aa  830    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  70.84 
 
 		 558 aa  837    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  72.04 
 
 		 522 aa  796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  67.07 
 
 		 597 aa  813    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  70.84 
 
 		 558 aa  837    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  69.26 
 
 		 557 aa  822    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  69.26 
 
 		 557 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  68.71 
 
 		 552 aa  802    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  78.67 
 
 		 556 aa  910    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  69.14 
 
 		 557 aa  820    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  68.03 
 
 		 542 aa  736    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  100 
 
 		 569 aa  1178    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  70.66 
 
 		 558 aa  833    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  72.2 
 
 		 553 aa  836    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  72.12 
 
 		 552 aa  845    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  70.3 
 
 		 557 aa  831    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  49.46 
 
 		 555 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  48.26 
 
 		 547 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  46.55 
 
 		 552 aa  518  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  43.31 
 
 		 567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  43.46 
 
 		 546 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  43.81 
 
 		 532 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  42.5 
 
 		 551 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  45.17 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  44.27 
 
 		 571 aa  422  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  42.21 
 
 		 540 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  41.92 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  42.4 
 
 		 532 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  43.11 
 
 		 540 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  41.92 
 
 		 541 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  42.11 
 
 		 541 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  44.53 
 
 		 603 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  42.21 
 
 		 540 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  41.87 
 
 		 529 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  41.83 
 
 		 506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  41.44 
 
 		 550 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  39.5 
 
 		 537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  41.31 
 
 		 548 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  40.07 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  41.21 
 
 		 563 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  41.38 
 
 		 528 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  41.91 
 
 		 575 aa  392  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  40.9 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  40.91 
 
 		 550 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  40.93 
 
 		 552 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  40.34 
 
 		 549 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  40.93 
 
 		 552 aa  382  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  39.96 
 
 		 559 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  39.65 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  41.09 
 
 		 548 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  41.57 
 
 		 563 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  32.21 
 
 		 573 aa  302  9e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  32.03 
 
 		 573 aa  297  4e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  34.08 
 
 		 563 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  32.03 
 
 		 529 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.84 
 
 		 551 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  28.82 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.5 
 
 		 539 aa  199  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.19 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  29.03 
 
 		 558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  29.27 
 
 		 506 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.56 
 
 		 545 aa  180  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  32.04 
 
 		 598 aa  163  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  27.58 
 
 		 506 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.66 
 
 		 528 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  26.92 
 
 		 539 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.16 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  25.79 
 
 		 546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  27.91 
 
 		 560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.22 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.8 
 
 		 531 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  27.01 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  27.21 
 
 		 674 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.95 
 
 		 503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  24.95 
 
 		 533 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  34.67 
 
 		 334 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  32.24 
 
 		 534 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.57 
 
 		 944 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  35.79 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  27.8 
 
 		 623 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  30.67 
 
 		 434 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  29.71 
 
 		 319 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  35 
 
 		 490 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  35.06 
 
 		 424 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  32.76 
 
 		 346 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  33.53 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  34.31 
 
 		 407 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  30.22 
 
 		 555 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  34.04 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  33.33 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  31.79 
 
 		 325 aa  80.1  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  30.51 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  34.09 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  31.77 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  27.8 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  35.04 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  28.15 
 
 		 487 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  31.25 
 
 		 398 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  31.25 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  39.56 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>