233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08546 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  100 
 
 
491 aa  1015    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  42.8 
 
 
539 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  41.58 
 
 
506 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  29.82 
 
 
552 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  30.37 
 
 
545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  31.95 
 
 
552 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  28.3 
 
 
551 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  29.81 
 
 
539 aa  186  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  30.77 
 
 
549 aa  186  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.73 
 
 
558 aa  183  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.28 
 
 
560 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  30.44 
 
 
563 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  30.73 
 
 
528 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  30.65 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.63 
 
 
503 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.58 
 
 
529 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  29.98 
 
 
546 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  28.54 
 
 
548 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  28.33 
 
 
567 aa  164  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  26.61 
 
 
575 aa  163  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  28.35 
 
 
563 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  28.49 
 
 
552 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  28.71 
 
 
552 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  28.35 
 
 
549 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.62 
 
 
546 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  28.54 
 
 
552 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  27.74 
 
 
553 aa  156  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  27.85 
 
 
551 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  27.57 
 
 
550 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  27.35 
 
 
547 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  27.8 
 
 
603 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  27.96 
 
 
555 aa  150  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.02 
 
 
569 aa  144  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  27.22 
 
 
550 aa  144  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  26.63 
 
 
552 aa  143  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  25.43 
 
 
597 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  26.68 
 
 
556 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  27.77 
 
 
550 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.68 
 
 
531 aa  143  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  28.57 
 
 
558 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.57 
 
 
558 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.57 
 
 
558 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.92 
 
 
552 aa  140  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  29.81 
 
 
522 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  29.11 
 
 
542 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  29.17 
 
 
529 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.57 
 
 
558 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  26.97 
 
 
571 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  29.31 
 
 
549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  26.85 
 
 
557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  26.64 
 
 
557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  26.64 
 
 
557 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  28.33 
 
 
434 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  27.37 
 
 
557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.61 
 
 
533 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  27.66 
 
 
537 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  33.6 
 
 
534 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.57 
 
 
528 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  24.47 
 
 
490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  34.02 
 
 
674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  28.07 
 
 
529 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  27.5 
 
 
559 aa  123  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  37.55 
 
 
579 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.2 
 
 
540 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.57 
 
 
540 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  27.98 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  27.13 
 
 
541 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  28.2 
 
 
532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  26.81 
 
 
541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  37.39 
 
 
325 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  26.81 
 
 
541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  26.01 
 
 
532 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  25.77 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  35.68 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  26.85 
 
 
563 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  27.1 
 
 
394 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.9 
 
 
555 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  33.03 
 
 
407 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  34.53 
 
 
334 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  24 
 
 
506 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  24.6 
 
 
420 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.31 
 
 
598 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  25.63 
 
 
944 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  32.28 
 
 
424 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.81 
 
 
574 aa  98.6  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  25.62 
 
 
623 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  37 
 
 
319 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  33.64 
 
 
323 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  34.65 
 
 
301 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  25.96 
 
 
573 aa  87  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  28.28 
 
 
318 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  25.66 
 
 
573 aa  84.3  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  32.24 
 
 
465 aa  84  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  25.94 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  32.09 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  32.09 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  32.69 
 
 
1103 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  32.54 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  31.65 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  31.65 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>