274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2455 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  93.86 
 
 		 522 aa  1021    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  89.95 
 
 		 557 aa  1067    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  71.37 
 
 		 569 aa  807    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  73.49 
 
 		 553 aa  840    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  89.61 
 
 		 558 aa  1065    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  68.87 
 
 		 597 aa  825    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  88.71 
 
 		 558 aa  1052    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  71.4 
 
 		 556 aa  835    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  99.1 
 
 		 557 aa  1149    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  100 
 
 		 557 aa  1156    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  75.86 
 
 		 552 aa  888    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  98.56 
 
 		 557 aa  1145    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  88.71 
 
 		 558 aa  1052    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  72.53 
 
 		 552 aa  849    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  70.65 
 
 		 542 aa  775    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  89.43 
 
 		 558 aa  1064    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  49.01 
 
 		 555 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  48.97 
 
 		 547 aa  545  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  49.52 
 
 		 552 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  43.29 
 
 		 567 aa  458  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  43.15 
 
 		 546 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  44.42 
 
 		 603 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  44.82 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  43.39 
 
 		 541 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  43.09 
 
 		 551 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  41.64 
 
 		 532 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  43.69 
 
 		 532 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  43.02 
 
 		 563 aa  421  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  43.53 
 
 		 541 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  43.33 
 
 		 541 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  42.23 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  43.5 
 
 		 540 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  43.5 
 
 		 540 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  42.61 
 
 		 506 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  42.06 
 
 		 550 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  43.74 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  43.11 
 
 		 540 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  42.56 
 
 		 528 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  41.1 
 
 		 549 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  42 
 
 		 575 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  41.58 
 
 		 537 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  40.49 
 
 		 548 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  43.24 
 
 		 552 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  42.48 
 
 		 549 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  40.99 
 
 		 550 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  43.24 
 
 		 552 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  41.32 
 
 		 549 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  41.72 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  41.07 
 
 		 563 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  40 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  43.24 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  37.62 
 
 		 573 aa  329  8e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  37.57 
 
 		 573 aa  325  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  34.1 
 
 		 563 aa  290  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.61 
 
 		 552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  29.39 
 
 		 506 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.68 
 
 		 551 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.96 
 
 		 529 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  29.73 
 
 		 552 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.78 
 
 		 539 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.7 
 
 		 545 aa  177  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  29.74 
 
 		 558 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.69 
 
 		 598 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.37 
 
 		 560 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.88 
 
 		 528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  25.96 
 
 		 514 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  30.39 
 
 		 534 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  25.79 
 
 		 579 aa  147  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  26.53 
 
 		 506 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  26.87 
 
 		 546 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  30.37 
 
 		 531 aa  143  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  26.64 
 
 		 491 aa  134  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.34 
 
 		 539 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.4 
 
 		 533 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.08 
 
 		 674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.29 
 
 		 503 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  33.33 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  35.11 
 
 		 334 aa  118  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.11 
 
 		 944 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  27.54 
 
 		 623 aa  93.6  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  30.25 
 
 		 434 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  34.95 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  33.88 
 
 		 490 aa  87.4  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.65 
 
 		 424 aa  87.4  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.61 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  35.39 
 
 		 394 aa  83.2  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  34.29 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  31.69 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  32.82 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  30.48 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  35.39 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31.52 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  29.85 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  30.53 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  31.05 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  33.73 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  29.61 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  25.73 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  29.47 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  34.04 
 
 		 1103 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>