128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2254 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  100 
 
 		 573 aa  1194    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  98.6 
 
 		 573 aa  1174    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  59.42 
 
 		 603 aa  685    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  59.85 
 
 		 571 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  37.68 
 
 		 563 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  39.2 
 
 		 546 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  38.37 
 
 		 555 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  41.3 
 
 		 551 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  39.38 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  35.33 
 
 		 552 aa  364  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  35.52 
 
 		 567 aa  355  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  35.59 
 
 		 557 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  35.41 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  36.36 
 
 		 558 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  36.36 
 
 		 558 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  35.23 
 
 		 557 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  36.52 
 
 		 558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  37.3 
 
 		 557 aa  336  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  37.06 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  34.75 
 
 		 558 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  36.79 
 
 		 542 aa  333  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  36.77 
 
 		 522 aa  331  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  37.03 
 
 		 549 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  36.84 
 
 		 553 aa  329  8e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  35.48 
 
 		 575 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  33.87 
 
 		 552 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  36.83 
 
 		 550 aa  326  8.000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  37.43 
 
 		 552 aa  323  4e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  35.52 
 
 		 541 aa  323  6e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  37.43 
 
 		 552 aa  323  6e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  35.35 
 
 		 552 aa  322  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  34.81 
 
 		 550 aa  321  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  35.98 
 
 		 506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  35.08 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  36.16 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  35.33 
 
 		 541 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  32.19 
 
 		 556 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  34.64 
 
 		 548 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  33.22 
 
 		 597 aa  317  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  33.39 
 
 		 569 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  34.94 
 
 		 541 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  34.13 
 
 		 540 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  35.27 
 
 		 532 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  35.27 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  34.25 
 
 		 532 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  34.82 
 
 		 528 aa  310  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  34.59 
 
 		 550 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  35.91 
 
 		 548 aa  310  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  34.46 
 
 		 540 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  33.1 
 
 		 537 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  33.33 
 
 		 529 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  33.84 
 
 		 563 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  34.65 
 
 		 559 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  28.72 
 
 		 563 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  27.31 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  26.46 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.04 
 
 		 558 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.46 
 
 		 552 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  27.57 
 
 		 539 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  24.46 
 
 		 551 aa  137  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  26.22 
 
 		 545 aa  134  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  24.63 
 
 		 560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  25.59 
 
 		 529 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.01 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  24.36 
 
 		 546 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  23.99 
 
 		 533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  26.29 
 
 		 579 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  22.92 
 
 		 531 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  23.1 
 
 		 539 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  25.6 
 
 		 506 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.11 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  24.05 
 
 		 528 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  25.11 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  28.71 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  27.51 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  26.27 
 
 		 623 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  24.93 
 
 		 944 aa  77.8  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.2 
 
 		 394 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.43 
 
 		 674 aa  77  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  27.92 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  25.54 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  26.74 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.72 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  28.65 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.26 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  26.03 
 
 		 325 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  24.86 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  27.5 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  25.93 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  27.47 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  27.72 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  29.44 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  30.94 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  29.51 
 
 		 301 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  23.53 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  29.39 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  25.18 
 
 		 555 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  26.98 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  26.35 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  26.35 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>