More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3483 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  100 
 
 
598 aa  1211    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  37.84 
 
 
674 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  38.12 
 
 
623 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  34.37 
 
 
944 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  32.3 
 
 
555 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  38.32 
 
 
407 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  31.46 
 
 
531 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  31.95 
 
 
546 aa  194  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  32.75 
 
 
533 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  35.96 
 
 
1103 aa  183  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  31.67 
 
 
579 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  30.91 
 
 
528 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  32.52 
 
 
558 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  35.54 
 
 
556 aa  176  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  32.31 
 
 
558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  32.31 
 
 
558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  32.11 
 
 
558 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  31.89 
 
 
557 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  31.89 
 
 
557 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.38 
 
 
522 aa  171  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  30.91 
 
 
546 aa  170  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  31.69 
 
 
557 aa  170  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  32.57 
 
 
552 aa  169  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  30.22 
 
 
532 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  33.13 
 
 
553 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  31.35 
 
 
557 aa  166  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  30.78 
 
 
541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.28 
 
 
551 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  30.61 
 
 
541 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  32.04 
 
 
569 aa  163  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  30.38 
 
 
541 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  31.33 
 
 
550 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31.09 
 
 
575 aa  160  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.35 
 
 
552 aa  160  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  30.06 
 
 
506 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.71 
 
 
540 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  29.31 
 
 
540 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  29.11 
 
 
532 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.05 
 
 
545 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  29.44 
 
 
540 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  30.95 
 
 
597 aa  156  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  29.75 
 
 
548 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.71 
 
 
529 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.36 
 
 
555 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  28.6 
 
 
547 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  42.6 
 
 
315 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  31.98 
 
 
542 aa  153  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  28.69 
 
 
537 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.57 
 
 
528 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  31.77 
 
 
574 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.84 
 
 
551 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  27.74 
 
 
559 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  32.2 
 
 
571 aa  150  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  43.22 
 
 
330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  29.4 
 
 
549 aa  148  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  29.24 
 
 
563 aa  147  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  42.65 
 
 
308 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  32.81 
 
 
603 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  30.08 
 
 
552 aa  145  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  28.09 
 
 
549 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  28.01 
 
 
552 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  31.14 
 
 
552 aa  144  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  28.05 
 
 
552 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.93 
 
 
560 aa  144  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  28.26 
 
 
529 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  29.71 
 
 
549 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  30.12 
 
 
550 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.45 
 
 
539 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.4 
 
 
552 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  27.63 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  29.41 
 
 
550 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  37.66 
 
 
334 aa  134  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.59 
 
 
503 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.71 
 
 
539 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  27.48 
 
 
548 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  29.44 
 
 
563 aa  127  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  27.91 
 
 
534 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  29.91 
 
 
567 aa  124  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  28.14 
 
 
558 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  37.82 
 
 
323 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  26.22 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  27.01 
 
 
573 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  28.54 
 
 
563 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  26.79 
 
 
573 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  33.74 
 
 
341 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  36.95 
 
 
391 aa  103  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.53 
 
 
318 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  33.33 
 
 
301 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.31 
 
 
491 aa  100  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  26.65 
 
 
506 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  28.03 
 
 
506 aa  92.8  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  33.33 
 
 
322 aa  91.3  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  33.49 
 
 
342 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  29.53 
 
 
424 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.31 
 
 
309 aa  87.4  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  26.49 
 
 
466 aa  87  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  28.42 
 
 
514 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.1 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  32.45 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  23.38 
 
 
456 aa  84.7  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>