262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4661 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  100 
 
 
341 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  56.89 
 
 
334 aa  394  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  60.83 
 
 
546 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  57.72 
 
 
528 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  54.7 
 
 
533 aa  275  7e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  54.96 
 
 
531 aa  262  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  50.39 
 
 
579 aa  259  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  37.34 
 
 
503 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  38.64 
 
 
552 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  36.24 
 
 
558 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  36.24 
 
 
558 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  37.21 
 
 
555 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  33.7 
 
 
567 aa  131  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  36.24 
 
 
558 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  36.24 
 
 
558 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.09 
 
 
309 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  37.39 
 
 
552 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  37.39 
 
 
552 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  35.66 
 
 
539 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  33.6 
 
 
549 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  36.02 
 
 
549 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  33.33 
 
 
557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  38.03 
 
 
550 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  32.38 
 
 
308 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  37.44 
 
 
546 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  37.89 
 
 
553 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  33.33 
 
 
557 aa  125  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  33.33 
 
 
545 aa  125  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  32.92 
 
 
522 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  38.1 
 
 
556 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  37.16 
 
 
547 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  32.92 
 
 
557 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  34.93 
 
 
557 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  34.6 
 
 
674 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.08 
 
 
407 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  30.99 
 
 
330 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  39.04 
 
 
597 aa  122  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  39.13 
 
 
552 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  35.64 
 
 
563 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  33.33 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  32.72 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  37.37 
 
 
548 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  29.53 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  35.38 
 
 
551 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  35.64 
 
 
552 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  35.68 
 
 
491 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  32.09 
 
 
542 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  35.79 
 
 
569 aa  119  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  34.27 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.37 
 
 
574 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  28.88 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  27.27 
 
 
322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  33.33 
 
 
552 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  32.94 
 
 
548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  33.74 
 
 
598 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  36.61 
 
 
434 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  27.81 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  35.5 
 
 
550 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  34.5 
 
 
529 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  34.57 
 
 
571 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  33.05 
 
 
541 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  32.27 
 
 
551 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  35.06 
 
 
603 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.74 
 
 
529 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  33.47 
 
 
541 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  33.47 
 
 
541 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  28.82 
 
 
398 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  33.74 
 
 
506 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  35.75 
 
 
506 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  33.51 
 
 
575 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  35.29 
 
 
559 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  32.11 
 
 
537 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  27.1 
 
 
386 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  33.89 
 
 
549 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  31.58 
 
 
563 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  28.82 
 
 
384 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  31.33 
 
 
532 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  31.33 
 
 
540 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  31.33 
 
 
540 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  31.76 
 
 
540 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  28.48 
 
 
353 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  30.8 
 
 
563 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.57 
 
 
555 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  33.84 
 
 
528 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  32.45 
 
 
529 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  30.74 
 
 
319 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  27.1 
 
 
393 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  27.97 
 
 
342 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.46 
 
 
346 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  28.48 
 
 
323 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  31.82 
 
 
550 aa  99  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  32.31 
 
 
534 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  32.63 
 
 
532 aa  96.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.84 
 
 
539 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  30.74 
 
 
490 aa  95.9  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  25.6 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  26.9 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  28.77 
 
 
424 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  27.46 
 
 
1103 aa  92.8  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  30.81 
 
 
560 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>