244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0532 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  100 
 
 		 342 aa  710    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  51.48 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  49.86 
 
 		 353 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  49.69 
 
 		 322 aa  339  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  51.82 
 
 		 398 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  51.21 
 
 		 384 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  50.91 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  51.22 
 
 		 393 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  51.65 
 
 		 346 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  48.13 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  49.4 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  49.4 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  46.64 
 
 		 341 aa  291  8e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  45.6 
 
 		 323 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  43.41 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  33.33 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  35.69 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  38.18 
 
 		 301 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  34.53 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  32.32 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  33.33 
 
 		 555 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.77 
 
 		 315 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  33.89 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  27.47 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.85 
 
 		 407 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  31.94 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.92 
 
 		 574 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  34.53 
 
 		 944 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  29.68 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.84 
 
 		 674 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  25.98 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  35.89 
 
 		 623 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30.77 
 
 		 1103 aa  93.2  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  31.63 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  34.95 
 
 		 420 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  31.31 
 
 		 563 aa  89.7  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  33.49 
 
 		 598 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.84 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  34.41 
 
 		 556 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  34.25 
 
 		 603 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  33.33 
 
 		 571 aa  86.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  30.59 
 
 		 490 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  32.35 
 
 		 552 aa  85.9  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  28.69 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  29.31 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  33.71 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  33.33 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  32.26 
 
 		 552 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.82 
 
 		 528 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  30.98 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  34.04 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.41 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  27.45 
 
 		 591 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.11 
 
 		 533 aa  79.7  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  31.67 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  27.48 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  29 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  31.28 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.43 
 
 		 546 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29.05 
 
 		 579 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  28.64 
 
 		 531 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.75 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.85 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  30.35 
 
 		 557 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  30.11 
 
 		 557 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.94 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  32.07 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  31.76 
 
 		 542 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  31.55 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  28.34 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  30.11 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  30.11 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  29.56 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  30.11 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  30.39 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  29.63 
 
 		 947 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  30.11 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  29.89 
 
 		 558 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.17 
 
 		 491 aa  72.8  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.05 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.32 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  28.45 
 
 		 550 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  28.83 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  31.32 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  35.2 
 
 		 506 aa  69.7  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  27.88 
 
 		 549 aa  69.7  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  28.57 
 
 		 548 aa  69.3  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  30.43 
 
 		 549 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.55 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  28.19 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  29.03 
 
 		 537 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  27.94 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  27.94 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  30.89 
 
 		 551 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  29.29 
 
 		 552 aa  66.2  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  27.94 
 
 		 540 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  29.29 
 
 		 552 aa  66.2  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  27.54 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  27.54 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  28.03 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>