235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1824 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  100 
 
 		 534 aa  1041    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  43.48 
 
 		 529 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  39.57 
 
 		 552 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  37.29 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  36.84 
 
 		 551 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  34.98 
 
 		 552 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  36.35 
 
 		 558 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  33.13 
 
 		 545 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  33.87 
 
 		 560 aa  243  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  32.73 
 
 		 548 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  34.77 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  33.88 
 
 		 549 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  33.46 
 
 		 575 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  32.87 
 
 		 549 aa  206  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  30.46 
 
 		 563 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  32.85 
 
 		 552 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  30.78 
 
 		 546 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  34.18 
 
 		 552 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  29.69 
 
 		 563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.35 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  34.16 
 
 		 559 aa  189  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  31.32 
 
 		 548 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  32.03 
 
 		 551 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  32.62 
 
 		 550 aa  186  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  31.44 
 
 		 567 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.98 
 
 		 571 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  32.08 
 
 		 539 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  29.96 
 
 		 547 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  30.68 
 
 		 553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.71 
 
 		 603 aa  177  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  31.35 
 
 		 563 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  31.85 
 
 		 542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  30.49 
 
 		 569 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  30.54 
 
 		 557 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  30.09 
 
 		 522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  31.06 
 
 		 558 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  29.74 
 
 		 597 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  30.54 
 
 		 557 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  30.84 
 
 		 558 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  30.06 
 
 		 557 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  30.54 
 
 		 557 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  28.57 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  29.65 
 
 		 558 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  29.65 
 
 		 558 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  27.19 
 
 		 552 aa  163  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  29.5 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.73 
 
 		 556 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  30.49 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  30.16 
 
 		 541 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  26.9 
 
 		 491 aa  160  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  29.68 
 
 		 552 aa  158  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  30.71 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  29.62 
 
 		 541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.14 
 
 		 529 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  28.74 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29.9 
 
 		 579 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  30.21 
 
 		 506 aa  153  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  27.45 
 
 		 549 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  29.5 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  29.13 
 
 		 529 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  28.91 
 
 		 532 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.86 
 
 		 546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  29.2 
 
 		 540 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  29.01 
 
 		 540 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  27.36 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.7 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  28.34 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.49 
 
 		 598 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  31.6 
 
 		 503 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.67 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  30.28 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.53 
 
 		 944 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  25.32 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  29.17 
 
 		 514 aa  106  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  35.4 
 
 		 325 aa  106  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  26.26 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  27.15 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.38 
 
 		 674 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  31.78 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  32.75 
 
 		 341 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  35.11 
 
 		 334 aa  94.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  31.34 
 
 		 490 aa  94.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  31.91 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  24.88 
 
 		 555 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.9 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31.31 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.08 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  30.22 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  32.48 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  27.88 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  27.88 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  30.16 
 
 		 574 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.79 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  32.46 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  28.24 
 
 		 394 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.91 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  34.81 
 
 		 308 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  31.45 
 
 		 623 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  33.33 
 
 		 315 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  35.19 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>