253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3397 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  100 
 
 		 546 aa  1115    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  52.22 
 
 		 531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  48.05 
 
 		 533 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  40.54 
 
 		 528 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  39.41 
 
 		 579 aa  340  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  63.76 
 
 		 334 aa  318  2e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  60.83 
 
 		 341 aa  294  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.95 
 
 		 598 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.66 
 
 		 545 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.87 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  29.21 
 
 		 546 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  30.71 
 
 		 539 aa  183  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  32.12 
 
 		 552 aa  180  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  32.12 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  29.69 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  30.38 
 
 		 549 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  29.04 
 
 		 551 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.52 
 
 		 539 aa  176  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.01 
 
 		 674 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  29.53 
 
 		 552 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  31.13 
 
 		 547 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  27.83 
 
 		 560 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  28.63 
 
 		 555 aa  167  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.21 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  27.37 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  27.57 
 
 		 552 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  28.14 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  27.76 
 
 		 556 aa  159  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  27.27 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  27.27 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  29.08 
 
 		 550 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  28.22 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  29.62 
 
 		 491 aa  157  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  28.69 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  28.57 
 
 		 553 aa  154  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  30.21 
 
 		 558 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.49 
 
 		 529 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  28.26 
 
 		 603 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  28.51 
 
 		 529 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.23 
 
 		 541 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.63 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  29.42 
 
 		 540 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.29 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.29 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  29.04 
 
 		 549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  27.04 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.8 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.29 
 
 		 558 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  29.34 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.43 
 
 		 541 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  28.6 
 
 		 540 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  28.29 
 
 		 558 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  26.83 
 
 		 550 aa  148  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.33 
 
 		 528 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.67 
 
 		 552 aa  147  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  27.16 
 
 		 557 aa  146  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.58 
 
 		 529 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  27.31 
 
 		 550 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  26.87 
 
 		 557 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  25.54 
 
 		 569 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  28.87 
 
 		 506 aa  144  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  27.37 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  27.17 
 
 		 571 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  25.44 
 
 		 557 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  28.42 
 
 		 575 aa  140  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  26.26 
 
 		 557 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  28.99 
 
 		 542 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  27.73 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  26.48 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  26.32 
 
 		 597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  27.1 
 
 		 548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  27.04 
 
 		 552 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  28.51 
 
 		 623 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  27.91 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  36.82 
 
 		 315 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  35.62 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  34.7 
 
 		 555 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  25.85 
 
 		 563 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.44 
 
 		 309 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  32.26 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  25.25 
 
 		 944 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  34.38 
 
 		 434 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  32.12 
 
 		 330 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  24.95 
 
 		 573 aa  107  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  24.54 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  24.95 
 
 		 573 aa  104  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  31.62 
 
 		 574 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  32.43 
 
 		 318 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  28.32 
 
 		 319 aa  99.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  35.27 
 
 		 308 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  30.2 
 
 		 301 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.92 
 
 		 424 aa  96.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  38.64 
 
 		 325 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  30.51 
 
 		 490 aa  93.6  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.89 
 
 		 394 aa  93.2  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  28.75 
 
 		 322 aa  88.6  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  27.15 
 
 		 1103 aa  88.6  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  29.2 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  34.25 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  30.95 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>