260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2670 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  100 
 
 		 330 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  72.16 
 
 		 308 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  56.76 
 
 		 315 aa  328  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  50.83 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  50.22 
 
 		 555 aa  222  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  41.9 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  41.15 
 
 		 674 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  43.22 
 
 		 598 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  36.64 
 
 		 574 aa  149  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  36.65 
 
 		 1103 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  41.83 
 
 		 944 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  35.25 
 
 		 318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  31.67 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  33 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  32.44 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  44.39 
 
 		 623 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  30.99 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31.01 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  32.18 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  31.94 
 
 		 342 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  37.07 
 
 		 424 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  32.12 
 
 		 546 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  34.53 
 
 		 322 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  39.47 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  33.94 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  27.97 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  33.56 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  28.15 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  28.15 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  29.47 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  32.14 
 
 		 533 aa  99.4  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  35.78 
 
 		 552 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  28.15 
 
 		 398 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  34.42 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  27.59 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.75 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  31.27 
 
 		 775 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29.61 
 
 		 579 aa  92.8  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  34.43 
 
 		 528 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  28.53 
 
 		 347 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  34.9 
 
 		 549 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  27.53 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  37 
 
 		 551 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  35.11 
 
 		 603 aa  90.5  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  31.88 
 
 		 571 aa  89.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  34.03 
 
 		 550 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  33.7 
 
 		 325 aa  89.4  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  34.87 
 
 		 552 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  34.87 
 
 		 552 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  32.85 
 
 		 422 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  26.02 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  46.02 
 
 		 548 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  33.33 
 
 		 551 aa  86.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  27.27 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  33.51 
 
 		 539 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  26.74 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  33.82 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  34.31 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  34.31 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  34.31 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  33.5 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  32.08 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  32.88 
 
 		 548 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  34.74 
 
 		 558 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  34.45 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  31.91 
 
 		 503 aa  82.8  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  35.96 
 
 		 557 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  28 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  34.9 
 
 		 558 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  35.75 
 
 		 553 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  34.39 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  32.54 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  33.82 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  32.34 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  37.65 
 
 		 552 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  33.98 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  35.39 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  34.45 
 
 		 506 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  34.59 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  34.9 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  34.9 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  33.33 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  36.42 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  31.28 
 
 		 552 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  31.28 
 
 		 555 aa  79.7  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  29.54 
 
 		 560 aa  79.3  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  34.8 
 
 		 541 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  33.01 
 
 		 541 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  35.39 
 
 		 557 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  33.01 
 
 		 541 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  34.83 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.73 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  32.06 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  33.51 
 
 		 528 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  30.99 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  33.88 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  27.51 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  37.25 
 
 		 542 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  32.11 
 
 		 539 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  33.74 
 
 		 552 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>