222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0553 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  100 
 
 		 384 aa  803    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  91.46 
 
 		 398 aa  743    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  92.75 
 
 		 386 aa  736    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  91.84 
 
 		 393 aa  738    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  68.86 
 
 		 346 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  68.14 
 
 		 346 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  69.62 
 
 		 346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  69.69 
 
 		 347 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  51.62 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  48.18 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  51.71 
 
 		 342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  48.2 
 
 		 323 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  46.74 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  47.37 
 
 		 322 aa  301  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  45.59 
 
 		 341 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  35.6 
 
 		 309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  34.05 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  32 
 
 		 301 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  30.66 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  34.05 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  29.34 
 
 		 334 aa  126  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.02 
 
 		 407 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.64 
 
 		 323 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  26.3 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  30.07 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  28.15 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  32.75 
 
 		 555 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  27.34 
 
 		 574 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  33.33 
 
 		 623 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  31.76 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  28.82 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  28.38 
 
 		 319 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.83 
 
 		 944 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  30.67 
 
 		 674 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.05 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.75 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  32.13 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  28.57 
 
 		 1103 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  27.48 
 
 		 533 aa  80.1  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.37 
 
 		 546 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  31.1 
 
 		 503 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  34.67 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  32.68 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  30.45 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.19 
 
 		 579 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  27.8 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.77 
 
 		 571 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  32.81 
 
 		 552 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  32.98 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  27.4 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  29.1 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.41 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  30.73 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26.24 
 
 		 528 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.47 
 
 		 557 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  28.95 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.53 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  29.47 
 
 		 552 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33.33 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  28.95 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  25.91 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.29 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  29.05 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  27.8 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  28.31 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  27.8 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  31.31 
 
 		 558 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  28.95 
 
 		 557 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  29.36 
 
 		 548 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  35.94 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  32.24 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  31.58 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  31.58 
 
 		 552 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  27.43 
 
 		 550 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.42 
 
 		 558 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  33.01 
 
 		 584 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.42 
 
 		 558 aa  67  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  36.22 
 
 		 490 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  27.37 
 
 		 557 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  29.76 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.38 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  27.89 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.9 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30.05 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.68 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.63 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  24.75 
 
 		 563 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  25.74 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  28.52 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  33.85 
 
 		 551 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.69 
 
 		 551 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  27.05 
 
 		 764 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  32.73 
 
 		 1247 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  31.87 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  39.56 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  28.26 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  27.37 
 
 		 542 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  27.78 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  30.74 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  33.9 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>