195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4028 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  100 
 
 		 353 aa  732    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  55.56 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  51.36 
 
 		 342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  48.97 
 
 		 322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  48.66 
 
 		 393 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  48.8 
 
 		 398 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  48.91 
 
 		 386 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  48.18 
 
 		 384 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  50.16 
 
 		 341 aa  315  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  49.1 
 
 		 346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  48.8 
 
 		 346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  44.51 
 
 		 323 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  48.18 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  48.49 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  44.9 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  33.22 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  33.21 
 
 		 309 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  33.86 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.79 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  27.33 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  32.18 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  27.73 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  29.2 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  29.35 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  25.83 
 
 		 574 aa  99.8  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  28.48 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  31.15 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  31.33 
 
 		 555 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.93 
 
 		 1103 aa  93.2  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  26.32 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  35.19 
 
 		 623 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  25.21 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.41 
 
 		 533 aa  82.8  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.76 
 
 		 598 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  28.57 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  28.76 
 
 		 674 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.74 
 
 		 944 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  31.98 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.63 
 
 		 531 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  31.55 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  28.5 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.63 
 
 		 528 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  29.15 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.91 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  28.5 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.93 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  25.55 
 
 		 579 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.69 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  31.18 
 
 		 603 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  27.47 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  30.21 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  28.57 
 
 		 552 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  28.88 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  25.65 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  29.69 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  25.95 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  25.65 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  25.65 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  30.53 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  29.95 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  30.73 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  28.64 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  27.81 
 
 		 529 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  30.73 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  26.29 
 
 		 557 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  30.53 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.89 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  30.32 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  27.23 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  28.23 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  30.77 
 
 		 584 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  30.56 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.42 
 
 		 557 aa  56.6  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  28.57 
 
 		 534 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  28.57 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  29.36 
 
 		 560 aa  56.2  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  23.98 
 
 		 775 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  28.57 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  28.42 
 
 		 552 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  23.31 
 
 		 563 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  25.66 
 
 		 764 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  27.89 
 
 		 548 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  27.57 
 
 		 548 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.13 
 
 		 556 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  25.75 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  26.23 
 
 		 491 aa  53.1  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  30.96 
 
 		 333 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  26.64 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  26.64 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  28.44 
 
 		 457 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  27.54 
 
 		 457 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  34.75 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  27.5 
 
 		 550 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  34.19 
 
 		 545 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  27.13 
 
 		 947 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  24.32 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  26.53 
 
 		 552 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  27.19 
 
 		 512 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  28.43 
 
 		 339 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  34.91 
 
 		 512 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>