224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0513 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  100 
 
 		 341 aa  700    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  44.9 
 
 		 353 aa  293  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  46.34 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  44.94 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  44.86 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  46.5 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  45.9 
 
 		 386 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  42.81 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  46.06 
 
 		 393 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  45.59 
 
 		 384 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  47.58 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  46.6 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  46.3 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  46.34 
 
 		 346 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  43.94 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  34.71 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  35.71 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.77 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  30.87 
 
 		 325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  28.76 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  29.43 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  26.28 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  30.53 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  27.54 
 
 		 407 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  31.33 
 
 		 579 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  28.75 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.58 
 
 		 1103 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  33.17 
 
 		 394 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  28.93 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  24.78 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  35.07 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.37 
 
 		 555 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  30.13 
 
 		 531 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  35.2 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  35.9 
 
 		 623 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  29.86 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  29.87 
 
 		 528 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.82 
 
 		 533 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  29.45 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  33.8 
 
 		 944 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  36.27 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.24 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  27.48 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  34.13 
 
 		 674 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  33.51 
 
 		 569 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  28.33 
 
 		 490 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  25.98 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  30.11 
 
 		 571 aa  72.8  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  31.44 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  34.62 
 
 		 549 aa  70.1  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  33.87 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  30.42 
 
 		 548 aa  70.1  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  27.95 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  29.35 
 
 		 603 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  26.73 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.84 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  29.5 
 
 		 282 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  27.47 
 
 		 550 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  34.59 
 
 		 528 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.82 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  36.22 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  36.22 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  34.25 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  36.22 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.81 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  30.32 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  30 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  32.82 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  32.82 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  29.26 
 
 		 550 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  26.42 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  32.83 
 
 		 463 aa  62.8  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  26.81 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  33.15 
 
 		 551 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  31.25 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.09 
 
 		 552 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.15 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.49 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  34.78 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  28 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  30.05 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  29.76 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  31.58 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  28.42 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  32.31 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  30.49 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  31.52 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  43.96 
 
 		 529 aa  59.3  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  26.79 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  28.49 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  32.02 
 
 		 549 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  28.49 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  28.19 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  25.65 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  25.65 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  28.42 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1890  hypothetical protein  28.86 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  28.49 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  28.45 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  27.42 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>