18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1890 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1890  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  803    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1745  peptidase M28  48.96 
 
 
403 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0459901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11798  hypothetical protein  43.62 
 
 
428 aa  278  9e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000248048  hitchhiker  0.000230946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0244  aminopeptidase-like protein  27.68 
 
 
386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0757  peptidase M28  28.25 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2430  peptidase M28  22.59 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  27.03 
 
 
341 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  26.4 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  28.4 
 
 
323 aa  50.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  28.11 
 
 
476 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  28.74 
 
 
353 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  28.86 
 
 
341 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  27.47 
 
 
488 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  26.92 
 
 
342 aa  46.6  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1356  hypothetical protein  30.74 
 
 
641 aa  46.2  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.347792  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  26.52 
 
 
322 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  23.14 
 
 
335 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  28.91 
 
 
319 aa  43.1  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>