248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3316 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  100 
 
 		 341 aa  710    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  50 
 
 		 323 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  50.96 
 
 		 384 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  51.46 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  51.13 
 
 		 386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  50.32 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  48.87 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  49.37 
 
 		 353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  52.13 
 
 		 347 aa  315  6e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  50.77 
 
 		 346 aa  315  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  49.37 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  49.37 
 
 		 346 aa  305  6e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  47.69 
 
 		 352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  47.06 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  44.95 
 
 		 341 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  33.98 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  34.01 
 
 		 301 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  36.84 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.54 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  31 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.02 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  29.47 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  27.42 
 
 		 315 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  29.39 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  31.16 
 
 		 422 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  28.37 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  29.63 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  27.53 
 
 		 330 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.1 
 
 		 574 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  28.01 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  29.65 
 
 		 555 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  26.46 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  28.62 
 
 		 1103 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  32.52 
 
 		 623 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.35 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  32.58 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  32.84 
 
 		 944 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  31.25 
 
 		 571 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.8 
 
 		 579 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  31.09 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  28.65 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  28.65 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  27.2 
 
 		 490 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  33.52 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.46 
 
 		 674 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.73 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  30.58 
 
 		 503 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  27.98 
 
 		 603 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.51 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  30.1 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  25.73 
 
 		 563 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  25.86 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  29.73 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  27.03 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  28.86 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  24.88 
 
 		 546 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  26.11 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  34.58 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  26.23 
 
 		 552 aa  62.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  27.87 
 
 		 557 aa  62.8  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  26.78 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  28.42 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  28.76 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  27.27 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  27.08 
 
 		 567 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  24.19 
 
 		 531 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.37 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0920  peptidases M20 and M28  29.91 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  26.78 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  27.32 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  27.87 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  27.35 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  27.47 
 
 		 555 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  27.74 
 
 		 501 aa  60.1  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  27.32 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.44 
 
 		 528 aa  59.7  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  29.52 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  26.23 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  27.32 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  24.86 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  27.32 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  29.26 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  27.07 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  27.32 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  30.86 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  31.22 
 
 		 571 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  28.57 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  28.98 
 
 		 529 aa  57.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  28.16 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  27.22 
 
 		 550 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  26.64 
 
 		 625 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  25.14 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  33.91 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  29.75 
 
 		 563 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  26.98 
 
 		 573 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3224  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.4 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2430  peptidase M28  31.06 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  24.35 
 
 		 764 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  28.33 
 
 		 551 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  28.02 
 
 		 549 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>