235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1025 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  100 
 
 
319 aa  653    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  43.26 
 
 
309 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  42.29 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  35.76 
 
 
301 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  30.66 
 
 
386 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  30.66 
 
 
384 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  31.64 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  30.29 
 
 
398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  32.47 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  30.66 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  30.86 
 
 
346 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  30.18 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  29.51 
 
 
322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  29.72 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  29.41 
 
 
346 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  31.03 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  31 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  28.08 
 
 
352 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  28.7 
 
 
353 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  28.72 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  27.65 
 
 
334 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  30.29 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  26.75 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  29.7 
 
 
323 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  30.63 
 
 
308 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  35.15 
 
 
346 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  28.78 
 
 
574 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.32 
 
 
546 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.14 
 
 
531 aa  99  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  27.86 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  27.24 
 
 
407 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  30.32 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  30.77 
 
 
325 aa  89.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  29.41 
 
 
674 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  31.1 
 
 
944 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  31.61 
 
 
503 aa  85.9  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  26.24 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.61 
 
 
551 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  29.26 
 
 
555 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.17 
 
 
533 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  28.64 
 
 
546 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  32.89 
 
 
563 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  27.57 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  38.18 
 
 
550 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  29.61 
 
 
420 aa  82.4  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.7 
 
 
552 aa  82.4  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  32.22 
 
 
549 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  29.85 
 
 
506 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  36.3 
 
 
552 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  42.06 
 
 
549 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  29.81 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  28.14 
 
 
539 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  36.72 
 
 
547 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  25.71 
 
 
491 aa  79.7  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  28.63 
 
 
548 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  31.31 
 
 
534 aa  79  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.93 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  27.57 
 
 
528 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  40.57 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  40.57 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  26.44 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.44 
 
 
545 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  31.52 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  29.33 
 
 
575 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  39.45 
 
 
537 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29.7 
 
 
579 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  31.4 
 
 
623 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  27.72 
 
 
555 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  29.89 
 
 
783 aa  76.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.63 
 
 
1103 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  27.14 
 
 
553 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  41.35 
 
 
529 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  37.98 
 
 
541 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  32.35 
 
 
603 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  37.12 
 
 
532 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  35.14 
 
 
771 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  38.71 
 
 
506 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  33.95 
 
 
541 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  33.95 
 
 
541 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  38.53 
 
 
571 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  33.49 
 
 
532 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  35.78 
 
 
567 aa  72.4  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  27.95 
 
 
560 aa  72.4  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  33.49 
 
 
540 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  33.49 
 
 
540 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  37.9 
 
 
529 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  31.25 
 
 
540 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  30.93 
 
 
550 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  37.98 
 
 
549 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  30.61 
 
 
616 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  26.6 
 
 
557 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  33.33 
 
 
514 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  30.73 
 
 
1247 aa  69.7  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  28.52 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  28.57 
 
 
529 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  27.7 
 
 
563 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  32.82 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  35.83 
 
 
550 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  38.74 
 
 
551 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  26.11 
 
 
558 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>