67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04750 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  100 
 
 		 783 aa  1599    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  45.99 
 
 		 799 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  36.09 
 
 		 771 aa  210  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  34.27 
 
 		 815 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  36.79 
 
 		 794 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5347  peptidase M28  26.56 
 
 		 772 aa  160  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  35.82 
 
 		 616 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  33.45 
 
 		 747 aa  130  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  25.91 
 
 		 937 aa  98.2  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0158707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  28.62 
 
 		 778 aa  93.2  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10522  Peptidase family M28 family (AFU_orthologue; AFUA_1G05960)  25.06 
 
 		 953 aa  81.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264533  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18580  predicted protein  26.59 
 
 		 877 aa  78.2  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000566018  normal  0.0108768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  23.93 
 
 		 775 aa  77  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  35.61 
 
 		 319 aa  73.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  33.77 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  32.37 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00550  expressed protein  26.46 
 
 		 898 aa  64.7  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  32.89 
 
 		 309 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  30.87 
 
 		 333 aa  60.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  26.28 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  26.41 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  31.65 
 
 		 342 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  28.57 
 
 		 1247 aa  56.2  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  36.17 
 
 		 514 aa  55.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  30.08 
 
 		 512 aa  53.9  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  28.03 
 
 		 344 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  30.77 
 
 		 373 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  34.83 
 
 		 506 aa  52  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  26.36 
 
 		 503 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  36.45 
 
 		 447 aa  51.2  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  34.88 
 
 		 341 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  36.45 
 
 		 447 aa  50.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  28.44 
 
 		 539 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  23.47 
 
 		 407 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  24.43 
 
 		 422 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  27.54 
 
 		 401 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  24.44 
 
 		 322 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  26.51 
 
 		 415 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  29.85 
 
 		 432 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  25.34 
 
 		 336 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.52 
 
 		 526 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.5 
 
 		 407 aa  49.3  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  38.37 
 
 		 488 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  37.08 
 
 		 552 aa  48.9  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  34.09 
 
 		 455 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  33.33 
 
 		 678 aa  48.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  26.09 
 
 		 401 aa  47.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0768  hypothetical protein  27.08 
 
 		 335 aa  47  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  29.1 
 
 		 444 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  29.1 
 
 		 437 aa  47.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  29.05 
 
 		 347 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  27.62 
 
 		 391 aa  46.2  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  30.49 
 
 		 525 aa  46.6  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  31.91 
 
 		 488 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  24.49 
 
 		 313 aa  45.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  30.54 
 
 		 368 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  33.33 
 
 		 308 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  32.59 
 
 		 526 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  36.05 
 
 		 325 aa  45.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7526  hypothetical protein  29.71 
 
 		 318 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  28.67 
 
 		 461 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  27.54 
 
 		 410 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  33.08 
 
 		 518 aa  44.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  26.79 
 
 		 308 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  27.33 
 
 		 330 aa  44.3  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.82 
 
 		 346 aa  44.3  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  32.33 
 
 		 519 aa  44.3  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>