201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6133 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  100 
 
 
461 aa  959    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  49.2 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  44.83 
 
 
526 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  41.43 
 
 
439 aa  306  6e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  40.6 
 
 
478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  39.12 
 
 
459 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  37.04 
 
 
468 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  40.67 
 
 
509 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  39.08 
 
 
450 aa  293  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  38.29 
 
 
456 aa  289  6e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  39.91 
 
 
472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  31.19 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  31.45 
 
 
546 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  28.21 
 
 
384 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  28.21 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  28.21 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  31.11 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  28.21 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  28.21 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  28.21 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  28.93 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  28.21 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  27.27 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  26 
 
 
528 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  32.26 
 
 
548 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  28.5 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  28.5 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.5 
 
 
417 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  25.87 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  24.77 
 
 
390 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  26.09 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  28.1 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  25.71 
 
 
677 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  30.2 
 
 
306 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  26.53 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  28 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  32.41 
 
 
325 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.23 
 
 
533 aa  61.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  28.92 
 
 
501 aa  60.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  26.63 
 
 
625 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  23.99 
 
 
591 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  24.52 
 
 
305 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  40.91 
 
 
815 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  42.86 
 
 
598 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  31.39 
 
 
674 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  33.94 
 
 
466 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  34.86 
 
 
465 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  34 
 
 
531 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  33.94 
 
 
466 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  33.33 
 
 
450 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  24.49 
 
 
394 aa  57.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  26.06 
 
 
420 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.2 
 
 
391 aa  57  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  25.11 
 
 
523 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  28.03 
 
 
568 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  30.72 
 
 
1103 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  33.94 
 
 
466 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  33.94 
 
 
466 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  29.85 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  35.4 
 
 
557 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  35.4 
 
 
557 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  32.58 
 
 
536 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  35.4 
 
 
557 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  35.78 
 
 
518 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  33.94 
 
 
584 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  33.03 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  35.51 
 
 
552 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  33.03 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  33.03 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  33.03 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  33.62 
 
 
541 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  33.62 
 
 
541 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  33.03 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  35.51 
 
 
552 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  33.03 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  34.82 
 
 
549 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  34.51 
 
 
522 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  32.09 
 
 
549 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  34.82 
 
 
539 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.77 
 
 
552 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  41.3 
 
 
487 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  23.76 
 
 
397 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  27.81 
 
 
539 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  25.68 
 
 
794 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  32.33 
 
 
512 aa  53.9  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  31.78 
 
 
571 aa  53.9  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  28.43 
 
 
436 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.97 
 
 
334 aa  53.5  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  31.82 
 
 
535 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  24.06 
 
 
397 aa  53.5  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  35.78 
 
 
503 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  32.76 
 
 
506 aa  53.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  37.38 
 
 
497 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  34.51 
 
 
563 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  33.63 
 
 
550 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  37.14 
 
 
747 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  33.33 
 
 
540 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  28.81 
 
 
491 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  33.62 
 
 
540 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  33.71 
 
 
545 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>