172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1679 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  100 
 
 		 459 aa  951    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  67.9 
 
 		 456 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  80.22 
 
 		 468 aa  752    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  66.74 
 
 		 478 aa  622  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  66 
 
 		 472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  65.07 
 
 		 509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  56.88 
 
 		 450 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  45.11 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  46.24 
 
 		 455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  42.08 
 
 		 526 aa  332  8e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  39.12 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  28.83 
 
 		 501 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  29.95 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  31.11 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  28.85 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  31.11 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  31.11 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  27.95 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  25.43 
 
 		 568 aa  66.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  28.85 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  24.58 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  28.27 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  29.56 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  29.56 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  29.56 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  29.56 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  29.56 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  29.56 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  27.19 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  29.06 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  30 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  28.99 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  24.67 
 
 		 504 aa  59.7  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  28.44 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  26.59 
 
 		 305 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  36.59 
 
 		 598 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  37.96 
 
 		 625 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  33.88 
 
 		 537 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  25.61 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  26.11 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  24.91 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  39.33 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  38.55 
 
 		 555 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  32.17 
 
 		 434 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  38.3 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  38.55 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  24.42 
 
 		 541 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  24.42 
 
 		 541 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  24.44 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  36.54 
 
 		 523 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  25.55 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  34.65 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  23.32 
 
 		 322 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  26.84 
 
 		 540 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  26.5 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  26.84 
 
 		 532 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  41.56 
 
 		 301 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  26.84 
 
 		 540 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.49 
 
 		 497 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  37.38 
 
 		 522 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  33.05 
 
 		 550 aa  53.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  27.44 
 
 		 540 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  28.14 
 
 		 575 aa  53.5  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  26.29 
 
 		 318 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  32.81 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  36.54 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  40.91 
 
 		 563 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  25.97 
 
 		 541 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  32.43 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  34.29 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  32.79 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  31.37 
 
 		 502 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  27.57 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  40.96 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  34.58 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  29.75 
 
 		 546 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  33.71 
 
 		 533 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  37.35 
 
 		 476 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  33.06 
 
 		 556 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  31.33 
 
 		 545 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  35.9 
 
 		 323 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  34.38 
 
 		 518 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  27.98 
 
 		 346 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  36.45 
 
 		 557 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  36.45 
 
 		 557 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.06 
 
 		 532 aa  50.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  30.7 
 
 		 333 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  29.61 
 
 		 309 aa  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  29.2 
 
 		 394 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  21.64 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  42.86 
 
 		 775 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  35.51 
 
 		 557 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  37.33 
 
 		 571 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  25.77 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  34.56 
 
 		 558 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  34.55 
 
 		 535 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  26.47 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.22 
 
 		 1103 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  34.55 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>