157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3608 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  100 
 
 		 472 aa  974    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  74.41 
 
 		 478 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  75.99 
 
 		 509 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  66 
 
 		 459 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  60.53 
 
 		 468 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  60.67 
 
 		 456 aa  557  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  53.48 
 
 		 450 aa  468  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  45.83 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  45.13 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  42.17 
 
 		 526 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  39.91 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  29 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  24.3 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  30.24 
 
 		 625 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  28.7 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  26.47 
 
 		 591 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  28.7 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  29.2 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  26.05 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  41.05 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  32.57 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.57 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  30.34 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  27.27 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  31.86 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  27.34 
 
 		 532 aa  57  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  27.52 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  27.52 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  28.18 
 
 		 347 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  27.49 
 
 		 540 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  26.15 
 
 		 322 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  27.98 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  38.1 
 
 		 338 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  29.78 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  25.33 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  30.58 
 
 		 537 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  29.21 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  29.21 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  25.71 
 
 		 528 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  34.29 
 
 		 677 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  29.21 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  29.21 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  29.21 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  29.21 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  29.31 
 
 		 342 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  30.54 
 
 		 309 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  27.34 
 
 		 506 aa  53.9  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  24.24 
 
 		 430 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  24.27 
 
 		 346 aa  53.5  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  28.71 
 
 		 541 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  28.71 
 
 		 541 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  36.14 
 
 		 555 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  35.58 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  27.88 
 
 		 532 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  32.41 
 
 		 535 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  35.96 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  27.88 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  27.88 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  30.05 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  37.14 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  24.89 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  37.14 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  25.64 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  29.53 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  37.33 
 
 		 323 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  32.41 
 
 		 536 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  27.14 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  29.91 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  30.97 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  25.35 
 
 		 528 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  35.51 
 
 		 466 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  35.51 
 
 		 466 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  31.06 
 
 		 533 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  35.51 
 
 		 466 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  31.93 
 
 		 504 aa  50.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  35.51 
 
 		 466 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  23.44 
 
 		 497 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  35.51 
 
 		 466 aa  50.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  22.51 
 
 		 353 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  33.02 
 
 		 462 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  33.33 
 
 		 502 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  35.51 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  35.51 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  38.53 
 
 		 512 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  35.51 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  32.54 
 
 		 743 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  26.42 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  26.09 
 
 		 551 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  25.75 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  28.12 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  36.73 
 
 		 312 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  28.24 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  34.91 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  35.11 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  28.29 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  32.69 
 
 		 571 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  34.58 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  34.58 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  21.89 
 
 		 546 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  35.78 
 
 		 1247 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>