116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1875 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3608  peptidase M28  75.99 
 
 		 472 aa  663    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  77.85 
 
 		 478 aa  713    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1875  peptidase M28  100 
 
 		 509 aa  1051    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1679  peptidase M28  65.07 
 
 		 459 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03479  probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  61.57 
 
 		 468 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1646  peptidase M28  60.42 
 
 		 456 aa  538  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104319  normal  0.645217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10643  Probable aminopeptidase fused to fibronectin type 3 domain  56.12 
 
 		 450 aa  480  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1949  peptidase M28  47.94 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  46.1 
 
 		 455 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  42.76 
 
 		 526 aa  329  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  40.67 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  26.64 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  25.26 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1044  peptidase M28  29.57 
 
 		 306 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202745 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.75 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3219  peptidase M28  29.78 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.115329  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  29.52 
 
 		 677 aa  64.3  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  28.5 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  28.5 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  24.68 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  24.68 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  24.36 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0031  hypothetical protein  27.98 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  25.22 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  31.03 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  29.77 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  27.16 
 
 		 625 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  24.56 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  29.77 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  25.53 
 
 		 408 aa  57  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0032  hypothetical protein  25.98 
 
 		 397 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  39.78 
 
 		 598 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.04 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  25.7 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  31.03 
 
 		 523 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  26.97 
 
 		 322 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  28.02 
 
 		 352 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  29.05 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.19 
 
 		 346 aa  54.3  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  28.49 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  28.49 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  28.49 
 
 		 384 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  28.49 
 
 		 408 aa  53.9  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  28.49 
 
 		 408 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1467  peptidase M28  27.62 
 
 		 305 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  29.84 
 
 		 325 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30.14 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  27.68 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  28.67 
 
 		 540 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  28.67 
 
 		 532 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  24.2 
 
 		 420 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  28.67 
 
 		 540 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  33.93 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  28.95 
 
 		 430 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  30.7 
 
 		 462 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  25.45 
 
 		 518 aa  50.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  35.29 
 
 		 338 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  32.98 
 
 		 391 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3374  hypothetical protein  25.95 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0508877  normal  0.0110235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  32.17 
 
 		 536 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  34.06 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  32.17 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  24.22 
 
 		 537 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1163  hypothetical protein  28.1 
 
 		 398 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  30.37 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  30.37 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  30.25 
 
 		 515 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  30.41 
 
 		 540 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  41.03 
 
 		 341 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  32.41 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  27.19 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  29.9 
 
 		 575 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  43.21 
 
 		 525 aa  47.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  39.81 
 
 		 544 aa  47  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  26.79 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  30.48 
 
 		 333 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  26.34 
 
 		 323 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  36.71 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  28.75 
 
 		 342 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  33.33 
 
 		 584 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  29.55 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  27.39 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  34.21 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  30.48 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  37.04 
 
 		 1103 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  30.84 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  25.93 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0187  peptidase M28  32.95 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 481 aa  46.2  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  26.45 
 
 		 743 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  28.7 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  33.64 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  29.81 
 
 		 557 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  28.04 
 
 		 533 aa  44.3  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  29.88 
 
 		 309 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07035  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04210)  29.7 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  33.65 
 
 		 539 aa  44.3  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.81 
 
 		 557 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  29.81 
 
 		 557 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  31.48 
 
 		 551 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>