118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4460 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  100 
 
 
794 aa  1540    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5347  peptidase M28  43.29 
 
 
772 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2824  peptidase M28  39.92 
 
 
771 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264014  normal  0.0144765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  27.95 
 
 
799 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  28.61 
 
 
783 aa  220  7e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  39.74 
 
 
815 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  40.49 
 
 
747 aa  182  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  44.75 
 
 
778 aa  170  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3936  peptidase M28  35.4 
 
 
616 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46351  predicted protein  27.46 
 
 
937 aa  99  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0158707 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10522  Peptidase family M28 family (AFU_orthologue; AFUA_1G05960)  25.75 
 
 
953 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264533  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00550  expressed protein  27.36 
 
 
898 aa  78.2  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187013  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18580  predicted protein  27.4 
 
 
877 aa  73.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000566018  normal  0.0108768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  31.58 
 
 
775 aa  72.8  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  42.68 
 
 
539 aa  67.4  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  43.68 
 
 
544 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  29.58 
 
 
333 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  36.04 
 
 
525 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  36.75 
 
 
512 aa  59.7  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  30.1 
 
 
450 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  30.09 
 
 
944 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1835  peptidase M28  26.84 
 
 
315 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.174438  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  27.14 
 
 
373 aa  58.9  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  39.51 
 
 
552 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  37.86 
 
 
391 aa  57.8  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  22.79 
 
 
512 aa  57.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  38.95 
 
 
514 aa  57  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  30.57 
 
 
947 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  27.27 
 
 
548 aa  56.6  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  30.32 
 
 
342 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  40 
 
 
525 aa  55.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  28.07 
 
 
437 aa  55.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  27.78 
 
 
325 aa  54.3  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  25.46 
 
 
568 aa  53.9  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  26.57 
 
 
319 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6133  peptidase M28  25.68 
 
 
461 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  26.4 
 
 
313 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  36.59 
 
 
526 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  29.46 
 
 
512 aa  52.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  30.95 
 
 
346 aa  52.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  28.03 
 
 
725 aa  51.6  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  34.94 
 
 
578 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  24.24 
 
 
325 aa  51.2  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  33.91 
 
 
339 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  23.93 
 
 
323 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  30.89 
 
 
436 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  24.58 
 
 
513 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  26.83 
 
 
591 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  26.79 
 
 
495 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  23.94 
 
 
488 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  30.06 
 
 
347 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  31.93 
 
 
550 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  23.86 
 
 
398 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  28.57 
 
 
502 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  24.92 
 
 
325 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  28.99 
 
 
309 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  27.86 
 
 
318 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  27.22 
 
 
312 aa  49.3  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  27.89 
 
 
301 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  29.09 
 
 
501 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  29.09 
 
 
501 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  29.09 
 
 
501 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  24.29 
 
 
314 aa  48.9  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1065  peptidase M28  36.47 
 
 
455 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.377443  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  37.97 
 
 
512 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  24.31 
 
 
515 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  28.37 
 
 
519 aa  48.5  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  33.68 
 
 
559 aa  48.5  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 
388 aa  48.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  24.7 
 
 
518 aa  48.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1748  peptidase M28  26.4 
 
 
430 aa  48.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  34.07 
 
 
526 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1307  peptidase M28  29.51 
 
 
299 aa  47.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0681394  normal  0.0392161 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  33.33 
 
 
534 aa  47.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  33.33 
 
 
552 aa  47.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7526  hypothetical protein  28.26 
 
 
318 aa  47.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  23.08 
 
 
510 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.78 
 
 
309 aa  47.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  27.46 
 
 
734 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  25.62 
 
 
502 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  35.53 
 
 
800 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  25 
 
 
518 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  23.94 
 
 
463 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  32.56 
 
 
563 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  27.38 
 
 
463 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  31.78 
 
 
420 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  26.39 
 
 
574 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  37.21 
 
 
678 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  29 
 
 
579 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  33.33 
 
 
629 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  40.24 
 
 
457 aa  45.8  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  35.37 
 
 
472 aa  46.2  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  31.2 
 
 
372 aa  45.8  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  23.41 
 
 
1147 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  23.53 
 
 
1077 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  25.81 
 
 
472 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25 
 
 
465 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  34.94 
 
 
772 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  33.7 
 
 
506 aa  45.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  38.27 
 
 
471 aa  45.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>