242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0906 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  100 
 
 		 544 aa  1097    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  47.78 
 
 		 552 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  41.58 
 
 		 578 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  44.89 
 
 		 525 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  41.6 
 
 		 539 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  31.95 
 
 		 526 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  29.39 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  28.48 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  26.64 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  27.41 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  28.06 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  26.86 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  27.17 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  27.37 
 
 		 481 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  26.35 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  27.64 
 
 		 468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  28.27 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  26.64 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  29.25 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  27.46 
 
 		 477 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  26.81 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  29.66 
 
 		 525 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  26.43 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  25.42 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  26.98 
 
 		 473 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  26.06 
 
 		 468 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  26.8 
 
 		 457 aa  94.4  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  25.05 
 
 		 469 aa  93.2  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.96 
 
 		 487 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  24.95 
 
 		 454 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  26.03 
 
 		 468 aa  87.8  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.31 
 
 		 497 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  24.39 
 
 		 580 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  34.62 
 
 		 947 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  27.8 
 
 		 678 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  31.84 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  26.14 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  29.13 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  31.1 
 
 		 815 aa  74.3  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  33.15 
 
 		 519 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  30.08 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  27.06 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  31.35 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  28.41 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  29.02 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  30.35 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  28.52 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  45.98 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  36.22 
 
 		 1131 aa  67.8  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  43.68 
 
 		 794 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  28.57 
 
 		 291 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  25.79 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.09 
 
 		 944 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  35.66 
 
 		 524 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  40.52 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  27.01 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  39.13 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  40 
 
 		 563 aa  64.7  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  28.78 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  25.83 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  31.85 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  38.89 
 
 		 551 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  29.73 
 
 		 503 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  31.85 
 
 		 552 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  29.67 
 
 		 312 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  27.24 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  31.82 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  32.16 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  29.18 
 
 		 597 aa  62  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  30 
 
 		 416 aa  62  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  40 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  36.75 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  37.29 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  35.88 
 
 		 751 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  36.96 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  35.29 
 
 		 757 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  27.59 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  42.7 
 
 		 772 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  37.61 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  36.44 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  36.44 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  39.08 
 
 		 775 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  35.85 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  35 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  37.14 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  39.22 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  29.82 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  38.46 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  29.82 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  30.48 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  29.82 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  26.86 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  23.15 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  38.18 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  42.86 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  34.02 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  38.53 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  26.4 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  25.12 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>