129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0412 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  100 
 
 		 460 aa  947    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  68.48 
 
 		 454 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  56.93 
 
 		 463 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  55.1 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  48.81 
 
 		 458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  45.25 
 
 		 580 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  39.1 
 
 		 525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  36.17 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  35.73 
 
 		 468 aa  243  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  35.93 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  35.73 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  35.58 
 
 		 495 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  36.38 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  34.19 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  36.38 
 
 		 468 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  34.85 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  35.57 
 
 		 477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  36.38 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  35.68 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  37.97 
 
 		 414 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  34.68 
 
 		 481 aa  226  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  32.61 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  33.88 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  36.19 
 
 		 468 aa  220  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  31.53 
 
 		 469 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  33.49 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  34.66 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  32.86 
 
 		 471 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  31.61 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  30.11 
 
 		 471 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  30.27 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.14 
 
 		 497 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.74 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  25.6 
 
 		 552 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  23.37 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  23.04 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  22.74 
 
 		 578 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  29.68 
 
 		 544 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  23.85 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  24.77 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  25.34 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  26.81 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.81 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  26.03 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  26.03 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  26.3 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  26.3 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  28.37 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  28.37 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  26.03 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  26.03 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  26.03 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  35.04 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  28.37 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  23.23 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  26.22 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  36.79 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  36.79 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  36.79 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  36.79 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  36.79 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  26.27 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  35.85 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.96 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  34.48 
 
 		 408 aa  57  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  27.49 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  32.79 
 
 		 751 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  27.49 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  27.98 
 
 		 677 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  25.56 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  33.65 
 
 		 308 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  39.76 
 
 		 725 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  32.04 
 
 		 504 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  31.33 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  24.29 
 
 		 456 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  26.97 
 
 		 584 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  34.29 
 
 		 347 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  26.54 
 
 		 884 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  27.38 
 
 		 463 aa  53.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  26.96 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  40.24 
 
 		 727 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  29.05 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  38.27 
 
 		 523 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  29 
 
 		 743 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  34.52 
 
 		 678 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  30 
 
 		 550 aa  50.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  32.69 
 
 		 335 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  35.56 
 
 		 559 aa  50.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  24.92 
 
 		 440 aa  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0531  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.95 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  25.6 
 
 		 734 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  22.88 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  33.01 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3859  peptidase M28  33.02 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  23.08 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28372  leucyl aminopeptidase precursor  33.33 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  23.26 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04080  peptidase, putative  38.55 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  27.08 
 
 		 547 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>