225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1182 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  100 
 
 
481 aa  958    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  51.77 
 
 
518 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  53.12 
 
 
515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  51.36 
 
 
548 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  49.57 
 
 
512 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  47.99 
 
 
512 aa  349  6e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  47.81 
 
 
536 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  48.1 
 
 
509 aa  340  4e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  47.58 
 
 
535 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  46.88 
 
 
555 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  45.82 
 
 
512 aa  323  6e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  49.43 
 
 
506 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  48.62 
 
 
514 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  46.88 
 
 
512 aa  306  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  43.06 
 
 
512 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  43.99 
 
 
534 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  43.9 
 
 
513 aa  290  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  42.58 
 
 
500 aa  280  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  42.23 
 
 
501 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  40.98 
 
 
503 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  42 
 
 
501 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  42 
 
 
501 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  41.98 
 
 
524 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  42.14 
 
 
510 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  40 
 
 
488 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  41.47 
 
 
502 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  38.13 
 
 
488 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  38.13 
 
 
479 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  38.13 
 
 
479 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  37.81 
 
 
479 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  52.16 
 
 
518 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  36.21 
 
 
502 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  36.3 
 
 
533 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  52.16 
 
 
519 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  52.48 
 
 
502 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  41.73 
 
 
1147 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  41.83 
 
 
1077 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  44.18 
 
 
312 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  43.89 
 
 
947 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  39.48 
 
 
1131 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  42.13 
 
 
313 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  38.08 
 
 
437 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  38.72 
 
 
309 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  34.76 
 
 
291 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  30.15 
 
 
466 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  28.72 
 
 
466 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  30.46 
 
 
466 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  30.46 
 
 
466 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  28.72 
 
 
466 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  28.76 
 
 
466 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  28.72 
 
 
466 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  28.72 
 
 
466 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  30.15 
 
 
466 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  30.15 
 
 
465 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  29.5 
 
 
466 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.42 
 
 
391 aa  97.8  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31.08 
 
 
450 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.73 
 
 
487 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  28.61 
 
 
584 aa  90.5  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  31.52 
 
 
571 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  29.24 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  27.85 
 
 
457 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.84 
 
 
497 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  33.33 
 
 
625 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  29.66 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  29.28 
 
 
775 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  26.98 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  29.27 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  25.33 
 
 
598 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  27.74 
 
 
416 aa  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  28.09 
 
 
440 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  33.86 
 
 
1247 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.42 
 
 
456 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.14 
 
 
944 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  35.2 
 
 
463 aa  63.5  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  34.75 
 
 
539 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.83 
 
 
552 aa  63.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  35.16 
 
 
330 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  25.85 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  45.57 
 
 
525 aa  61.6  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  36.8 
 
 
552 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  27.59 
 
 
544 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  35.43 
 
 
308 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  32.26 
 
 
481 aa  60.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  25.58 
 
 
438 aa  60.1  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  26.58 
 
 
472 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  35.45 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3155  peptidase M28  30.59 
 
 
436 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000680764  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  29.82 
 
 
563 aa  58.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  28.77 
 
 
468 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  29.89 
 
 
335 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  30.77 
 
 
468 aa  57  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  27.42 
 
 
447 aa  56.6  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  30.77 
 
 
477 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  28.31 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  26.04 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  38.1 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  31.4 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  41.96 
 
 
1035 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  32.76 
 
 
407 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.534474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>