234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2728 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  67.72 
 
 		 466 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  67.09 
 
 		 477 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  72.34 
 
 		 468 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  100 
 
 		 481 aa  986    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  68.78 
 
 		 469 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  72.34 
 
 		 468 aa  644    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  69.47 
 
 		 468 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  69.26 
 
 		 468 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  78.15 
 
 		 481 aa  760    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  69.68 
 
 		 468 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  72.56 
 
 		 468 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  72.56 
 
 		 468 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  69.05 
 
 		 468 aa  623  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  73.9 
 
 		 414 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  66.67 
 
 		 467 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  58.24 
 
 		 472 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  51.41 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  49.07 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  47.89 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  46.65 
 
 		 471 aa  353  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  47.6 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  40.99 
 
 		 468 aa  316  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  42.82 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  40.57 
 
 		 525 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  37.06 
 
 		 495 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  35.24 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  36.96 
 
 		 458 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  33.26 
 
 		 472 aa  240  5e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 580 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  33.48 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  34.68 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.65 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  25.88 
 
 		 539 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  23.98 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  23.83 
 
 		 552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.34 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  26.81 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  29.14 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  23.37 
 
 		 578 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.81 
 
 		 456 aa  93.2  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  27.91 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  25.86 
 
 		 698 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  24.38 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  23.88 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  23.37 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  23.48 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  23.66 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  23.66 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  23.48 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  23.48 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.76 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  33.74 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  24.92 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  24.33 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.11 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  27.13 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  26.45 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  39.8 
 
 		 512 aa  70.1  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  23.81 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  31.1 
 
 		 775 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  22.48 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  25.17 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  23.03 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  26.64 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  24.53 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  26.25 
 
 		 308 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  38.89 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  22.6 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  33.06 
 
 		 734 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  28.26 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  38.04 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  27.23 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  42 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  27.19 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  29.74 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  36.67 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  27.83 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  29.8 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  33.33 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  27.04 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  32.81 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  33.33 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  32.81 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  28.16 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  26.06 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  38.38 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.13 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  39.77 
 
 		 678 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  40.66 
 
 		 725 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  29.32 
 
 		 757 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  33.77 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  42.7 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  42.7 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  41.98 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  41.98 
 
 		 536 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  37.37 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  27.48 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  41.25 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  26.71 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  26.37 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>