145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1367 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  52.92 
 
 		 757 aa  786    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  55.39 
 
 		 743 aa  791    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  100 
 
 		 751 aa  1537    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  44.37 
 
 		 727 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  39.36 
 
 		 725 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  37.1 
 
 		 678 aa  435  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  35.8 
 
 		 712 aa  429  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  33.99 
 
 		 734 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  34.39 
 
 		 800 aa  340  5e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  32.52 
 
 		 772 aa  323  6e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  30.04 
 
 		 884 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  32.45 
 
 		 911 aa  303  6.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72031  glutamated carboxypeptidase  24.96 
 
 		 847 aa  147  8.000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80203  vacuolar targeting protein  27.72 
 
 		 896 aa  80.5  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397004  normal  0.0921162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  40 
 
 		 497 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  41.18 
 
 		 539 aa  71.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  44.83 
 
 		 525 aa  70.1  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.19 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  38 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  25.91 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  34.01 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  26.09 
 
 		 559 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  37.25 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  39.32 
 
 		 334 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  27.07 
 
 		 512 aa  62  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  26.82 
 
 		 545 aa  62  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  35.88 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  35.29 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  31.49 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  24.6 
 
 		 550 aa  58.9  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  25.66 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  28.3 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  36 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  27.27 
 
 		 549 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  27.86 
 
 		 416 aa  56.6  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  32.79 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  31.02 
 
 		 503 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  26.07 
 
 		 547 aa  55.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  33.1 
 
 		 536 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  27.36 
 
 		 556 aa  55.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  34.19 
 
 		 525 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  27.36 
 
 		 549 aa  55.5  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  33.1 
 
 		 535 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  33.08 
 
 		 458 aa  54.7  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  34.86 
 
 		 947 aa  54.3  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  27.09 
 
 		 557 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  26.76 
 
 		 557 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  27.09 
 
 		 558 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  27.09 
 
 		 557 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  23.16 
 
 		 555 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  25.14 
 
 		 563 aa  53.9  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  37.25 
 
 		 815 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  34.23 
 
 		 346 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  25.41 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  30.58 
 
 		 468 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  23.28 
 
 		 528 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  27.4 
 
 		 552 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.13 
 
 		 531 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  31.54 
 
 		 523 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  38.2 
 
 		 483 aa  52.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  26.04 
 
 		 542 aa  52.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  27.09 
 
 		 558 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  27.52 
 
 		 553 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  33.33 
 
 		 323 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  27.16 
 
 		 579 aa  52  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  27.09 
 
 		 558 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  27.09 
 
 		 558 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  31.86 
 
 		 481 aa  51.6  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  26.76 
 
 		 522 aa  51.6  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  28.16 
 
 		 552 aa  51.2  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.3 
 
 		 503 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  28.16 
 
 		 552 aa  51.2  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  30.09 
 
 		 481 aa  50.8  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  28.28 
 
 		 512 aa  50.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  33.02 
 
 		 578 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  37.37 
 
 		 548 aa  50.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  34.44 
 
 		 468 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  35.64 
 
 		 467 aa  50.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  31.78 
 
 		 468 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  32.71 
 
 		 468 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  34.55 
 
 		 477 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  33.03 
 
 		 502 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  31.78 
 
 		 469 aa  50.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  32.98 
 
 		 501 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  32.11 
 
 		 519 aa  50.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  33.96 
 
 		 472 aa  49.3  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  34.44 
 
 		 468 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  26.42 
 
 		 557 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  23.21 
 
 		 537 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  29.01 
 
 		 473 aa  48.9  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  33.33 
 
 		 468 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  30.28 
 
 		 312 aa  48.9  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  36.59 
 
 		 468 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  26.06 
 
 		 552 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  23.59 
 
 		 541 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  31.25 
 
 		 463 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  25.53 
 
 		 550 aa  48.5  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  33.98 
 
 		 417 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  33.98 
 
 		 417 aa  47.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  30.94 
 
 		 555 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0650469 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>