217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3240 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  97.22 
 
 
468 aa  904    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  85.51 
 
 
414 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  97.22 
 
 
468 aa  905    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  68.28 
 
 
481 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  70.15 
 
 
466 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  100 
 
 
468 aa  952    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  86.75 
 
 
468 aa  831    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  72.26 
 
 
477 aa  681    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  85.9 
 
 
468 aa  827    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  69.38 
 
 
481 aa  666    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  86.54 
 
 
468 aa  830    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  97.01 
 
 
468 aa  900    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  85.65 
 
 
469 aa  828    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  71.92 
 
 
468 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  70.86 
 
 
467 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  55.99 
 
 
472 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  46.67 
 
 
469 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  48.08 
 
 
473 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  48.72 
 
 
471 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  45.82 
 
 
471 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  47.06 
 
 
471 aa  335  7.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  40.49 
 
 
468 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  42.86 
 
 
457 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  38.59 
 
 
525 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  36.2 
 
 
472 aa  259  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  36.46 
 
 
495 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  35.44 
 
 
454 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  35.08 
 
 
458 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  34.06 
 
 
463 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  34.78 
 
 
460 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  34.67 
 
 
580 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  27.88 
 
 
525 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  24.41 
 
 
552 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  27.86 
 
 
539 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  26.08 
 
 
578 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  27.64 
 
 
544 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  24.47 
 
 
526 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  24.84 
 
 
497 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.07 
 
 
487 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.16 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  25.41 
 
 
698 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  26.56 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  24.28 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  41.38 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  28.28 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  29.87 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  29.67 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  39.8 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  31.74 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  27.39 
 
 
462 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  26.17 
 
 
503 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  23.5 
 
 
463 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.64 
 
 
501 aa  63.9  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  29.18 
 
 
512 aa  63.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  28.36 
 
 
416 aa  63.5  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  27.43 
 
 
515 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  26.61 
 
 
319 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  39.13 
 
 
523 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  24.45 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  38.64 
 
 
678 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  40 
 
 
502 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  35.29 
 
 
512 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  27 
 
 
677 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  29.04 
 
 
502 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  23.8 
 
 
438 aa  59.3  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  31.22 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  38.89 
 
 
559 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  31.22 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  31.75 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  35.48 
 
 
528 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  32.58 
 
 
734 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  40.74 
 
 
524 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  42.68 
 
 
513 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  25.68 
 
 
291 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  28.48 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  34.19 
 
 
510 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  32.54 
 
 
757 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  43.37 
 
 
535 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  43.37 
 
 
536 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  43.21 
 
 
504 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  25.58 
 
 
479 aa  57.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  42.86 
 
 
548 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  37.63 
 
 
725 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  36.84 
 
 
550 aa  57.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  30.32 
 
 
417 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  27.08 
 
 
434 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  22.5 
 
 
465 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  38.54 
 
 
534 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  38.89 
 
 
743 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  45.65 
 
 
629 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.44 
 
 
775 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  30.69 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  30.69 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  24.09 
 
 
447 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  34.65 
 
 
514 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  28.14 
 
 
518 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  37.65 
 
 
947 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  40 
 
 
547 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.18 
 
 
466 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  33.33 
 
 
533 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>