245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0344 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  100 
 
 
534 aa  1070    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  60.21 
 
 
512 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  46.61 
 
 
548 aa  350  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  45.53 
 
 
512 aa  348  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  41.65 
 
 
535 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  41.53 
 
 
536 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  41.25 
 
 
518 aa  319  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  42.51 
 
 
515 aa  316  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  41.3 
 
 
512 aa  315  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  43.84 
 
 
509 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  42.51 
 
 
512 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  41.39 
 
 
500 aa  299  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  41.91 
 
 
514 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  40.04 
 
 
502 aa  299  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  42.89 
 
 
524 aa  295  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  37.77 
 
 
555 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  43.99 
 
 
481 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  43.61 
 
 
506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  40.85 
 
 
501 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  40.85 
 
 
501 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  40.85 
 
 
501 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  38.79 
 
 
513 aa  279  8e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  38.58 
 
 
510 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  38.98 
 
 
512 aa  239  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  38.81 
 
 
503 aa  233  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  36.48 
 
 
479 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  36.26 
 
 
479 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  36.26 
 
 
479 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  33.63 
 
 
488 aa  216  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  34.04 
 
 
488 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  48.08 
 
 
502 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  36.7 
 
 
533 aa  189  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  38.11 
 
 
502 aa  188  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  43.75 
 
 
518 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  43.97 
 
 
519 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  48.78 
 
 
312 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  45.93 
 
 
1147 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  45.93 
 
 
1077 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  45.45 
 
 
947 aa  156  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  41.15 
 
 
313 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  37.85 
 
 
1131 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  38.65 
 
 
437 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  35.78 
 
 
291 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  34.19 
 
 
309 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  29.23 
 
 
465 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  28.82 
 
 
391 aa  107  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  26.54 
 
 
466 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  30.75 
 
 
450 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  26.33 
 
 
466 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  26.87 
 
 
466 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  28.24 
 
 
466 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  28.24 
 
 
466 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  27.2 
 
 
466 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  27.2 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  27.2 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  26.94 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  26.27 
 
 
466 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  30.38 
 
 
584 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  28.12 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  26.05 
 
 
598 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  27.79 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  34.52 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  32.41 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  32 
 
 
727 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  25.99 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  29.72 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  30.07 
 
 
571 aa  74.3  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  38.89 
 
 
525 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  28.24 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  29.2 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  37.3 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  25 
 
 
457 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  26.76 
 
 
456 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  36.54 
 
 
454 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  27.05 
 
 
440 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  31.77 
 
 
539 aa  65.9  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.51 
 
 
775 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.13 
 
 
497 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  27.01 
 
 
544 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.27 
 
 
555 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  28.24 
 
 
468 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  28.76 
 
 
447 aa  63.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.81 
 
 
1103 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  26.76 
 
 
339 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.96 
 
 
944 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  32.51 
 
 
625 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  26.28 
 
 
481 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  38.38 
 
 
578 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  26.72 
 
 
468 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  25.93 
 
 
459 aa  60.1  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  29.12 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  41.58 
 
 
678 aa  59.7  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  32.54 
 
 
534 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  33.88 
 
 
373 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  25.57 
 
 
468 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  26.27 
 
 
462 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  27.96 
 
 
467 aa  60.1  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  27.97 
 
 
468 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  26.72 
 
 
469 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  29.83 
 
 
526 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>