189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2040 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  100 
 
 
578 aa  1200    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  51.3 
 
 
552 aa  541  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  41.58 
 
 
544 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  41.51 
 
 
525 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  35.39 
 
 
539 aa  334  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.31 
 
 
526 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  27.14 
 
 
468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  24.81 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  25.26 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  26.72 
 
 
468 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  23.33 
 
 
481 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  26.6 
 
 
468 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  23.74 
 
 
472 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  26.99 
 
 
468 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  24.53 
 
 
467 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  25.56 
 
 
466 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  25.32 
 
 
468 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  25.37 
 
 
458 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  25.23 
 
 
468 aa  107  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  25.59 
 
 
469 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  28.42 
 
 
495 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  24.86 
 
 
468 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  24.47 
 
 
468 aa  98.6  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  25.51 
 
 
477 aa  97.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  25.72 
 
 
471 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  25.16 
 
 
414 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  23.37 
 
 
481 aa  95.9  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  26.68 
 
 
472 aa  89  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  26.29 
 
 
454 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  25.73 
 
 
457 aa  88.2  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  25.33 
 
 
580 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  24.68 
 
 
471 aa  84  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  26.67 
 
 
473 aa  82  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  26.41 
 
 
463 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  23.77 
 
 
471 aa  77.8  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  24.94 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.11 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  30.19 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  38.78 
 
 
512 aa  73.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  40.74 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  32.12 
 
 
502 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  31.58 
 
 
512 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  37.38 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  29.96 
 
 
512 aa  67  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  34.55 
 
 
551 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  26.55 
 
 
468 aa  65.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  27.23 
 
 
312 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  29.15 
 
 
678 aa  64.7  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  31.25 
 
 
518 aa  63.9  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  30.45 
 
 
408 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  38.38 
 
 
534 aa  62  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  30.73 
 
 
519 aa  61.6  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  29.02 
 
 
947 aa  60.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  43.9 
 
 
548 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  29.55 
 
 
384 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  26.19 
 
 
503 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  29.09 
 
 
408 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  29.09 
 
 
408 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  29.02 
 
 
502 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  29.09 
 
 
384 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  29.09 
 
 
384 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  29.09 
 
 
384 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  29.28 
 
 
563 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  33.69 
 
 
509 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  28.64 
 
 
408 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  28.57 
 
 
552 aa  57.4  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  24.15 
 
 
466 aa  57  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  40.23 
 
 
757 aa  57  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  29.45 
 
 
552 aa  57  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.11 
 
 
1103 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  32.63 
 
 
574 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  28.02 
 
 
313 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  37.14 
 
 
524 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  27.52 
 
 
536 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  37.5 
 
 
338 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  33.09 
 
 
539 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  27.59 
 
 
772 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  34.26 
 
 
488 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  38.55 
 
 
535 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  40.48 
 
 
1131 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  26.42 
 
 
515 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  31.2 
 
 
518 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  33.86 
 
 
501 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  24.5 
 
 
463 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  33.86 
 
 
501 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  33.86 
 
 
501 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  27.38 
 
 
533 aa  54.7  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  29.92 
 
 
545 aa  53.9  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  28.02 
 
 
884 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  31.49 
 
 
512 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  42.25 
 
 
309 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  36.9 
 
 
333 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  29.31 
 
 
598 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  29.27 
 
 
512 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  33.33 
 
 
911 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.32 
 
 
417 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  23 
 
 
440 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  38.2 
 
 
526 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  37.21 
 
 
559 aa  51.6  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  24.62 
 
 
323 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>