168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6038 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  100 
 
 		 454 aa  932    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  68.48 
 
 		 460 aa  641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  57.21 
 
 		 463 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  58.23 
 
 		 472 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  51.58 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 580 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  40.05 
 
 		 525 aa  319  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  40.18 
 
 		 495 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  35.93 
 
 		 481 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  35.47 
 
 		 481 aa  257  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  35.93 
 
 		 468 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  35.5 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  35.06 
 
 		 468 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  36.19 
 
 		 469 aa  249  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  35.89 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  35.89 
 
 		 468 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  36.06 
 
 		 477 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  34.8 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  35.44 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  35.67 
 
 		 468 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  35.28 
 
 		 468 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  34.23 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  37.81 
 
 		 414 aa  237  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  33.47 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  33.78 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  36.87 
 
 		 473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  35.33 
 
 		 468 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  34.25 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  34.42 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  31.52 
 
 		 471 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  30.59 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  31.56 
 
 		 497 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  30.46 
 
 		 487 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.92 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  30.96 
 
 		 552 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  27.02 
 
 		 526 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  24.9 
 
 		 578 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  25.61 
 
 		 544 aa  97.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  24.27 
 
 		 539 aa  97.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.91 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  34.45 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  36.94 
 
 		 677 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  24.64 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.07 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  23.9 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  37.5 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  24.76 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  46.67 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  31.01 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  33.33 
 
 		 547 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  25.92 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  23.23 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  38.83 
 
 		 757 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  23.2 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  28.93 
 
 		 734 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  22.73 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  23.66 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  35.05 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  35.29 
 
 		 751 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  22.73 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  23.66 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  28.11 
 
 		 884 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  38.1 
 
 		 725 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  24.35 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  30.77 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  22.46 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  22.46 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  34.62 
 
 		 335 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  28.3 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  28.3 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  24.35 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  22.44 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  22.44 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  35.24 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  40.2 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  22.44 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  35.16 
 
 		 559 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  27.83 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  24.07 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  26.69 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  35.05 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  31.62 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  34.57 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  34.21 
 
 		 743 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  39.02 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  35.29 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  35.29 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  40 
 
 		 800 aa  57  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  34.31 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  34.31 
 
 		 384 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  34.31 
 
 		 384 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  34.31 
 
 		 384 aa  57  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  24.26 
 
 		 698 aa  57  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  34.31 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  33.98 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  39.08 
 
 		 533 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  27.96 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  36.46 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  28.24 
 
 		 772 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  32.69 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>