212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2654 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  100 
 
 
525 aa  1048    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  40.05 
 
 
454 aa  303  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  37.58 
 
 
458 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  40.05 
 
 
495 aa  280  6e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  39.1 
 
 
460 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  39.39 
 
 
472 aa  274  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  35.62 
 
 
463 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  40.09 
 
 
481 aa  272  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  39.24 
 
 
481 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  36.24 
 
 
472 aa  270  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  39.91 
 
 
466 aa  269  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  40.42 
 
 
471 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  39.02 
 
 
473 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  38.86 
 
 
468 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  38.53 
 
 
468 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  38.59 
 
 
468 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  39.95 
 
 
468 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  38.59 
 
 
468 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  38.39 
 
 
468 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  38 
 
 
477 aa  261  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  38.03 
 
 
468 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  38.89 
 
 
469 aa  259  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  38.53 
 
 
468 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  38.53 
 
 
468 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  38.42 
 
 
469 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  37.96 
 
 
467 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  36.26 
 
 
471 aa  249  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  39.5 
 
 
414 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  37.75 
 
 
471 aa  242  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 
580 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  35.54 
 
 
457 aa  229  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  27.62 
 
 
525 aa  159  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  29.32 
 
 
526 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  26.2 
 
 
552 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  27.19 
 
 
497 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  27.25 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.26 
 
 
578 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  29.66 
 
 
544 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  28.92 
 
 
487 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  26.16 
 
 
734 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  27.42 
 
 
447 aa  89.4  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  30.47 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  28.14 
 
 
479 aa  82  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  28.34 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  25.93 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  27.41 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  24.71 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  25.65 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  30.29 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  24.83 
 
 
456 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  28.08 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  30.6 
 
 
512 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  23.17 
 
 
512 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  25.62 
 
 
501 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  27.02 
 
 
725 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  25.55 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  30.71 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  28.77 
 
 
523 aa  66.6  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  37.5 
 
 
757 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  29.12 
 
 
678 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  25.34 
 
 
501 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  25.34 
 
 
501 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  29.95 
 
 
504 aa  64.7  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  27.16 
 
 
677 aa  64.7  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  25.23 
 
 
547 aa  64.3  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  24.79 
 
 
334 aa  64.3  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  25.41 
 
 
533 aa  64.3  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  26.73 
 
 
454 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  31.61 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  31.61 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  31.61 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  25.13 
 
 
743 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  36.04 
 
 
794 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  28.26 
 
 
416 aa  62.4  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  26.69 
 
 
341 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  25.21 
 
 
539 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  36.56 
 
 
727 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  30.89 
 
 
417 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  26 
 
 
512 aa  61.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  30.89 
 
 
417 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  24.1 
 
 
466 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  21.71 
 
 
465 aa  60.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  29.32 
 
 
417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  38.46 
 
 
559 aa  60.1  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  29.06 
 
 
346 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  24.26 
 
 
466 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  23.3 
 
 
503 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  25.77 
 
 
555 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  23.08 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  23.18 
 
 
698 aa  58.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  23.08 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  24.81 
 
 
546 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  23 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  29.81 
 
 
531 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  22.98 
 
 
466 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  23.76 
 
 
466 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  24.1 
 
 
466 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  23.08 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  23.08 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  27.75 
 
 
408 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>