176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0237 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  100 
 
 		 471 aa  939    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  52.43 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  47.85 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  46.64 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  48.61 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  46.3 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  48.37 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  46.52 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  49.88 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  48.94 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  48.05 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  48.03 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  48.72 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  46.68 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  48.49 
 
 		 468 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  49.67 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  44.99 
 
 		 468 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  44.68 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  46.07 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  46.32 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  46.87 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  48.15 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  42.73 
 
 		 471 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  40.55 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  39.3 
 
 		 495 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  32.97 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  32.75 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  33.11 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  33.94 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  32.31 
 
 		 460 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  32.49 
 
 		 580 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  27.66 
 
 		 539 aa  129  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  29.72 
 
 		 544 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  26.92 
 
 		 525 aa  114  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  26.27 
 
 		 526 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  26.87 
 
 		 578 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.27 
 
 		 497 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  27.54 
 
 		 698 aa  96.7  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  27.27 
 
 		 440 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  25.27 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  28.2 
 
 		 454 aa  91.3  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.71 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  26.05 
 
 		 463 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.25 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  25.58 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  25.58 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  25.58 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  25.58 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  25.21 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25.79 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  25.37 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  25 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  25.37 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  26.67 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  29 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  25.37 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  25.37 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  27.4 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  30.23 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  26.9 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  36.21 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  27.44 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  27.21 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  34.9 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  29.26 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  25.44 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  30.5 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  30.73 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  30.21 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  30.21 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  27.93 
 
 		 815 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  36.96 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  29.27 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  36.96 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  36.96 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  36.96 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  36.96 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  31.13 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  36.96 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  36.54 
 
 		 524 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  25.09 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  35.87 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  41.76 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  34.17 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  41.77 
 
 		 775 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  27.09 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  28.08 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  25.8 
 
 		 503 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  28.08 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  28.08 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  36.08 
 
 		 548 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  32.63 
 
 		 677 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  24.89 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  26.09 
 
 		 563 aa  55.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  33.64 
 
 		 514 aa  54.7  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  44.16 
 
 		 502 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  24.88 
 
 		 319 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1190  peptidase M28  34.42 
 
 		 629 aa  53.9  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.909659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  25.39 
 
 		 500 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  25.3 
 
 		 457 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>